Novel HILIC-ESI-MS method for urinary profiling of MSUD and methylmalonic aciduria biomarkers
Notice bibliographique
Résumé
Methyl malonic acid and branched-chain keto acids are important biomarkers for the diagnosis of cobalamin deficiencies and maple syrup urine disease. We report the development and validation of a HILIC-ESI-MS2 method for the quantification of these organic acids from neonatal urine. The samples were 100 times diluted and analyzed on a ZIC-HILIC column with 25-mM formic acid in water: 25-mM formic acid in acetonitrile (45:55) at a flow rate of 0.8 mL/min with a runtime of only 6 minutes. The method demonstrated a lower limit of detection of 10 ng/mL, Limit of Quantification (LOQ) of 50 ng/mL, linearity of r2 ≥ 0.990 and recoveries of 87-105% for all analytes. The intraday and interday precision CV's were <10% and 12%, respectively. Extensive stability studies demonstrated the analytes to be stable in stock and in matrix with a percent change within ±15%. The Bland-Altman analysis of the developed method with the gold standard GCMS method demonstrated a bias of 0.44, 0.11, 0.009 and -0.19 for methyl malonic acid, 3-methyl-2-oxovaleric acid, 2-hydroxy-3methylbutyric acid and 4-methyl-2-oxovaleric acid, respectively, proving the methods are comparable. The newly developed method involves no derivatization and has a simple sample preparation and a low runtime, enabling it to be easily automated with a high sample throughput in a cost-effective manner.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».