Abstract 2779: miR-142-3p as a regulator of RAC1 and a prognostic factor in melanoma
Notice bibliographique
Résumé
Abstract In order to identify miRNAs able to distinguish melanoma patients with good or poor prognosis, the expression profile of a panel of miRNAs evaluated in primary melanoma samples from 65 patients was compared to clinicopathological data from these patients (Breslow’s depth, mitotic counts, metastasis progression and survival). The miR-142-3p was identified as presenting at least 2-fold reduced expression in melanoma samples from patients with poor prognosis for 3 of 4 clinical parameters analyzed compared to melanoma samples from patients with good prognosis. The miR-142-3p expression was validated by RT-qPCR in primary human melanoma samples, confirming a significant lower expression in melanoma patients with poor prognosis compared to those with good prognosis. Searching for miR-142-3p mRNA targets in melanoma, the gene expression profile was analyzed by gene microarrays in a wild type and miR-142-3p overexpressing melanoma cell line. RAC1, ITGB8 e GNB2 were found as potential targets of this miRNA. Protein expression analyses in melanoma cell lines overexpressing the miR-142-3p reinforced the regulation of RAC1 by this miRNA. Functional assays showed that the overexpression of miR-142-3p leads to a reduced migratory ability compared to control cells, indicating its role in cell migration process. Finally, multivariate COX analyses demonstrated that high levels of RAC1 and reduced levels of miR-142-3p predict poor progression-free survival of melanoma patients, revealing these molecules as potential prognostic biomarkers for melanoma patients. Supported by FAPESP, CNPQ and CAPES Short title: miR-142-3p as a prognostic factor in melanoma Note: This abstract was not presented at the meeting. Citation Format: Adriana T. Cruz, Júlia A. Morata, Ana C. Monteiro, Ana Luísa P. Ayub, Roseli S. Soares, André Fujita, Fernando Andrade, Victor Tron, Miriam G. Jasiulionis. miR-142-3p as a regulator of RAC1 and a prognostic factor in melanoma [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2019; 2019 Mar 29-Apr 3; Atlanta, GA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2019;79(13 Suppl):Abstract nr 2779.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».