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Enregistrement W2956245605 · doi:10.1038/s41467-019-11576-0

Genome-wide association meta-analyses and fine-mapping elucidate pathways influencing albuminuria

2019· article· en· W2956245605 sur OpenAlexaff
Alexander Teumer, Yong Li, Sahar Ghasemi, Bram P. Prins, Matthias Wuttke, Tobias Hermle, Ayush Giri, Karsten B. Sieber, Chengxiang Qiu, Holger Kirsten, Adrienne Tin, Audrey Y. Chu, Nisha Bansal, Mary F. Feitosa, Lihua Wang, Jin Fang Chai, Massimiliano Cocca, Christian Fuchsberger, Mathias Gorski, Anselm Hoppmann, Katrin Horn, Man Li, Jonathan Marten, Damia Noce, Teresa Nutile, Sanaz Sedaghat, Garðar Sveinbjörnsson, Bamidele O. Tayo, Peter J. van der Most, Yizhe Xu, Zhi Yu, Lea Gerstner, Johan Ärnlöv, Stephan J. L. Bakker, Daniela Baptista, Mary L. Biggs, Eric Boerwinkle, Hermann Brenner, Ralph Burkhardt, Robert J. Carroll, Miao-Li Chee, Miao-Ling Chee, Mengmeng Chen, Ching‐Yu Cheng, James P. Cook, Josef Coresh, Tanguy Corre, John Danesh, Martin H. de Borst, Alessandro De Grandi, Renée de Mutsert, Aiko P. J. de Vries, Frauke Degenhardt, Katalin Dittrich, Jasmin Divers, Kai‐Uwe Eckardt, Georg Ehret, Karlhans Endlich, Janine F. Felix, Oscar H. Franco, André Franke, Barry I. Freedman, Sandra Freitag‐Wolf, Ron T. Gansevoort, Vilmantas Giedraitis, Martin Gögele, Franziska Grundner-Culemann, Daníel F. Guðbjartsson, Vilmundur Guðnason, Pavel Hamet, Tamara B. Harris, Andrew A. Hicks, Hilma Hólm, Valencia Hui Xian Foo, Shih‐Jen Hwang, M. Arfan Ikram, Erik Ingelsson, Vincent W. V. Jaddoe, Jóhanna Jakobsdóttir, Navya Shilpa Josyula, Bettina Jung, Mika Kähönen, Chiea Chuen Khor, Wieland Kieß, Wolfgang Köenig, Antje Körner, Péter Kovács, Holly Kramer, Bernhard K. Krämer, Florian Kronenberg, Leslie A. Lange, Carl D. Langefeld, Jeannette Jen-Mai Lee, Terho Lehtimäki, Wolfgang Lieb, S. M. L. Lim, Lars Lind, Cecilia M. Lindgren, Jianjun Liu, Markus Loeffler, Leo‐Pekka Lyytikäinen, Anubha Mahajan, Joseph Maranville, Deborah Mascalzoni, Barbara E. McMullen, Christa Meisinger, Thomas Meitinger, Kozeta Miliku, Dennis O. Mook‐Kanamori, Martina Müller‐Nurasyid, Josyf C. Mychaleckyj, Matthias Nauck, Kjell Nikus, Boting Ning, Raymond Noordam, Jeffrey O’ Connell, Ísleifur Ólafsson, Annette Peters, Anna Podgornaia, Belén Ponte, Tanja Poulain, Peter P. Pramstaller, Ton J. Rabelink, Laura M. Raffield, Dermot F. Reilly, Rainer Rettig, Myriam Rheinberger, Kenneth Rice, Fernando Rivadeneira, Heiko Runz, Kathleen A. Ryan, Charumathi Sabanayagam, Kai‐Uwe Saum, Ben Schöttker, Christian M. Shaffer, Yuan Shi, Albert V. Smith, Konstantin Strauch, Michael Stümvoll, Benjamin B. Sun, Silke Szymczak, E Shyong Tai, Nicholas Tan, Kent D. Taylor, Andrej Teren, Yih Chung Tham, Joachim Thiery, Chris H. L. Thio, Hauke Thomsen, Unnur Þorsteinsdóttir, Anke Tönjes, Johanne Tremblay, André G. Uitterlinden, Pim van der Harst, Niek Verweij, Suzanne Vogelezang, Uwe Völker, Mélanie Waldenberger, Chaolong Wang, Otis D. Wilson, Charlene Wong, Tien Yin Wong, Qiong Yang, Masayuki Yasuda, Shreeram Akilesh, Murielle Bochud, Carsten A. Böger, Olivier Devuyst, Todd L. Edwards, Kevin Ho, Andrew P. Morris, Afshin Parsa, Sarah A. Pendergrass, Bruce M. Psaty, Jerome I. Rotter, Kāri Stefánsson, James G. Wilson, Katalin Suszták, Harold Snieder, Iris M. Heid, Markus Scholz, Adam S. Butterworth, Adriana M. Hung, Cristian Pattaro, Anna Köttgen

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChronic Kidney Disease and Diabetes
Établissements canadiensMedpharmgene (Canada)Centre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNetherlands Heart InstituteUniversity of North Carolina at Chapel HillHuazhong University of Science and TechnologyUniversität ZürichUniversitair Medisch Centrum GroningenHôpitaux Universitaires de GenèveTongji UniversityNational Institutes of HealthRijksuniversiteit GroningenDeutsches KrebsforschungszentrumUniversiteit LeidenDuke-NUS Medical SchoolUniversity of WashingtonTongji Medical College, Huazhong University of Science and TechnologyMedical Research CouncilBiogenCelgeneKaiser Permanente Washington Health Research InstituteVanderbilt UniversityAlbert-Ludwigs-Universität FreiburgKaiser PermanenteHelmholtz Zentrum MünchenNational Institute for Health and Care ResearchU.S. Department of Veterans Affairs
Mots-clésAlbuminuriaGenome-wide association studyMedicineBiologySingle-nucleotide polymorphismBioinformaticsComputational biologyGeneGeneticsKidney diseaseInternal medicineGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Increased levels of the urinary albumin-to-creatinine ratio (UACR) are associated with higher risk of kidney disease progression and cardiovascular events, but underlying mechanisms are incompletely understood. Here, we conduct trans-ethnic (n = 564,257) and European-ancestry specific meta-analyses of genome-wide association studies of UACR, including ancestry- and diabetes-specific analyses, and identify 68 UACR-associated loci. Genetic correlation analyses and risk score associations in an independent electronic medical records database (n = 192,868) reveal connections with proteinuria, hyperlipidemia, gout, and hypertension. Fine-mapping and trans-Omics analyses with gene expression in 47 tissues and plasma protein levels implicate genes potentially operating through differential expression in kidney (including TGFB1, MUC1, PRKCI, and OAF), and allow coupling of UACR associations to altered plasma OAF concentrations. Knockdown of OAF and PRKCI orthologs in Drosophila nephrocytes reduces albumin endocytosis. Silencing fly PRKCI further impairs slit diaphragm formation. These results generate a priority list of genes and pathways for translational research to reduce albuminuria.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,172
Score d'incertitude au seuil0,528

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,067
Tête enseignante GPT0,334
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations238
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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