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Enregistrement W2956576079 · doi:10.1002/acn3.50824

Biallelic <i>CACNA2D2</i> variants in epileptic encephalopathy and cerebellar atrophy

2019· article· en· W2956576079 sur OpenAlexaff
Jaya Punetha, Ender Karaca, Alper Gezdirici, Ryan E. Lamont, Davut Pehli̇van, Dana Marafi, Juan Pablo Appendino, Jill V. Hunter, Zeynep Coban‐Akdemir, Jawid M. Fatih, Shalini N. Jhangiani, Richard A. Gibbs, A. Micheil Innes, Jennifer E. Posey, James R. Lupski

Notice bibliographique

RevueAnnals of Clinical and Translational Neurology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueGenetic Neurodegenerative Diseases
Établissements canadiensAlberta Children's HospitalUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of General Medical SciencesAmerican Brain FoundationNational Human Genome Research InstituteNational Institutes of HealthNational Heart, Lung, and Blood InstituteMuscular Dystrophy Association
Mots-clésMedicineCerebellar ataxiaEncephalopathyAtaxiaAtrophyEpilepsyGeneticsPathologyBiologyInternal medicinePsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: To characterize the molecular and clinical phenotypic basis of developmental and epileptic encephalopathies caused by rare biallelic variants in CACNA2D2. METHODS: Two affected individuals from a family with clinical features of early onset epileptic encephalopathy were recruited for exome sequencing at the Centers for Mendelian Genomics to identify their molecular diagnosis. GeneMatcher facilitated identification of a second family with a shared candidate disease gene identified through clinical gene panel-based testing. RESULTS: Rare biallelic CACNA2D2 variants have been previously reported in three families with developmental and epileptic encephalopathy, and one family with congenital ataxia. We identified three individuals in two unrelated families with novel homozygous rare variants in CACNA2D2 with clinical features of developmental and epileptic encephalopathy and cerebellar atrophy. Family 1 includes two affected siblings with a likely damaging homozygous rare missense variant c.1778G>C; p.(Arg593Pro) in CACNA2D2. Family 2 includes a proband with a homozygous rare nonsense variant c.485_486del; p.(Tyr162Ter) in CACNA2D2. We compared clinical and molecular findings from all nine individuals reported to date and note that cerebellar atrophy is shared among all. INTERPRETATION: Our study supports the candidacy of CACNA2D2 as a disease gene associated with a phenotypic spectrum of neurological disease that include features of developmental and epileptic encephalopathy, ataxia, and cerebellar atrophy. Age at presentation may affect apparent penetrance of neurogenetic trait manifestations and of a particular clinical neurological endophenotype, for example, seizures or ataxia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,502

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,093
Tête enseignante GPT0,360
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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