Use of the tau protein-to-peptide ratio in CSF to improve diagnostic classification of Alzheimer’s disease
Notice bibliographique
Résumé
Cerebrospinal fluid (CSF) tau and phospho-tau are well established biomarkers of Alzheimer's disease. While these measures are conventionally referred to as 'total tau' (T-tau) and 'phospho-tau' (P-tau), several truncated and modified tau forms exist that may relay additional diagnostic information. We evaluated the diagnostic performance of an endogenous tau peptide in CSF, tau 175-190, in the phosphorylated and non-phosphorylated state. A liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS) method was established to measure these peptides in CSF and was used to analyze two independent clinical cohorts; the first cohort included patients with Alzheimer's disease (AD, n = 15), Parkinson's disease (PD, n = 15), progressive supranuclear palsy (PSP, n = 15), and healthy controls (n = 15), the second cohort included AD patients (n = 16), and healthy controls (n = 24). In both cohorts T-tau and P-tau concentrations were determined by immunoassay. While tau 175-190 and P-tau 175-190 did not differentiate the study groups, the separation of AD and controls by T-tau (area under the ROC Curve (AUC) = 95%) and P-tau (AUC = 92%) was improved when normalizing the ELISA measurements to the concentrations of the endogenous peptides: T-tau/tau 175-190 (AUC = 100%), P-tau/P-tau 175-190 (AUC = 95%). The separation between patients and controls by T-tau (AUC = 88%) and P-tau (AUC = 82%) was similarly improved in the second cohort by taking the ratios of T-tau/tau 175-190 (AUC = 97%) and P-tau/P-tau 175-190 (AUC = 98%). In conclusion, our results suggest that the performance of the AD biomarkers T-tau and P-tau could be improved by normalizing their measurements to the endogenous peptides tau 175-190 and P-tau 175-190, possibly because these endogenous tau peptides serve to normalize for physiological, and disease-independent, secretion of tau from neurons to the extracellular space and the CSF. Finally, the observations made here add to the general applicability of mass spectrometry as a tool for rapid identification and accurate quantification of biomarker candidates.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,006 | 0,010 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».