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Enregistrement W2957770424 · doi:10.1101/702472

Application of a gut-immune co-culture system for the study of N-glycan-dependent host-pathogen interactions of <i>Campylobacter jejuni</i>

2019· preprint· en· W2957770424 sur OpenAlexfundno aff
Cristina Y. Zamora, Elizabeth M. Ward, Jemila C. Kester, Wen Li Kelly Chen, Jason Velazquez, Linda G. Griffith, Barbara Imperiali

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSalmonella and Campylobacter epidemiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthDefense Advanced Research Projects AgencyAlberta Glycomics Centre
Mots-clésCampylobacter jejuniImmune systemBiologyMicrobiologyInfectivityInnate immune systemFlagellinImmunologyBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract An in vitro gut-immune co-culture model with apical and basal accessibility, designed to more closely resemble a human intestinal microenvironment, was employed to study the role of the Nlinked protein glycosylation (Pgl) pathway in Campylobacter jejuni pathogenicity. The gutimmune co-culture (GIC) was developed to model important aspects of the human small intestine by the inclusion of mucin producing goblet cells, human enterocytes, and dendritic cells, bringing together a mucus-containing epithelial monolayer with elements of the innate immune system. The utility of the system was demonstrated by characterizing host-pathogen interactions facilitated by N-linked glycosylation, such as host epithelial barrier functions, bacterial invasion and immunogenicity. Changes in human intestinal barrier functions in the presence of 11168 C. jejuni (wildtype) strains were quantified using GICs. The glycosylationdeficient strain 11168 ΔpglE was 100-fold less capable of adhering to and invading this intestinal model in cell infectivity assays. Quantification of inflammatory signaling revealed that 11168ΔpglE differentially modulated inflammatory responses in different intestinal microenvironments, suppressive in some but activating in others. Virulence-associated outer membrane vesicles produced by wildtype and 11168ΔpglE C. jejuni were shown to have differential composition and function, with both leading to immune system activation when provided to the gut-immune co-culture model. This analysis of aspects of C. jejuni infectivity in the presence and absence of its N-linked glycome, is enabled by application of the gut-immune model and we anticipate that this system will be applicable to further studies of C. jejuni and other enteropathogens of interest.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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