Molecular Phylogeny of the Genus Acanthosaura (Agamidae)
Notice bibliographique
Résumé
A 900bp fragment of mitochondrial cytochrome b was sequenced from 63 specimens of the arboreal agamid lizard genus Acanthosaura from Vietnam, Laos, Myanmar (Burma), Thailand and Malaysia, representing all four currently recognized species. A hypothesis of maternal relationships was generated based on a maximum parsimony analysis of 44 different haplotypes. Pseudocalotes and Calotes were used as outgroup taxa. The genealogical analyses of the cytochrome b sequences recovered four lineages represented by A. armata, A. capra, A. crucigera, and A. lepidogaster. A fifth lineage consisted of one specimen from Ngoc Linh, Vietnam that was considered to be A. lepidogaster; however, recognizing it as such would render A. lepidogaster paraphyletic. Acanthosaura crucigera consisted of two clades. One of these clades contains cysteine in a portion of its cytochrome b, and is the sister group of all other species of Acanthosaura. In turn, the second clade of A. crucigera formed the sister group of A. armata, A. capra, and A. lepidogaster. A clade containing A. armata, A. capra and the sample from Ngoc Linh, Vietnam was the sister group to A. lepidogaster.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».