MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2960922831 · doi:10.1002/tax.12064

Species delimitation in the genus <i>Greenwayodendron</i> based on morphological and genetic markers reveals new species

2019· article· en· W2960922831 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueTaxon · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Diversity and Evolution
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAgence Nationale Des Parcs NationauxCentre National de la Recherche ScientifiqueAgence Universitaire de la FrancophonieFonds De La Recherche Scientifique - FNRSAustralian National Botanic GardensAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésBiologyAllopatric speciationHerbariumSympatric speciationSpecies complexPopulationEvolutionary biologyGenetic structureGenusRainforestTaxonZoologyPhylogenetic treeEcologyGenetic variationGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Combining genetic and morphological markers is a powerful approach for species delimitation, much needed in tropical species complexes. Greenwayodendron (Annonaceae) is a widespread genus of trees distributed from West to East African rainforests. Two species and four infra‐specific taxa are currently recognized. However, preliminary genetic studies and morphological observations suggested the occurrence of additional species, undescribed to date. We tested species delimitation within Greenwayodendron by combining morphological and population genetics data. First, a visual inspection of about a thousand specimens suggested the existence of seven morphogroups: four of them occur in Central Africa and overlap in Gabon while three others are allopatric, occurring respectively in West Africa, East Africa, and the islands of São Tomé and Príncipe. Their morphological differentiation was confirmed by analysis of 27 morphological characters coded from 233 herbarium specimens. Second, after genotyping 800 samples at eight nuclear microsatellites, Bayesian clustering analyses (STRUCTURE) identified four genetic clusters corresponding to the well‐sampled morphogroups but failed to separate the three remaining morphogroups represented by few samples. However, we show that this is an inherent limit of the STRUCTURE algorithm, whereas factorial correspondence analysis (FCA) and pairwise F ST and R ST measures confirmed the genetic differentiation of all morphogroups. We considered that a clear genetic differentiation occurring between sympatric populations advocates for recognizing distinct species following the biological species concept. Our analyses highlight that the current taxonomic treatment of Greenwayodendron underestimates the total number of species. We identified two new species and support separation at the rank of species of two varieties ( G. suaveolens subsp. suaveolens var. gabonica , G. suaveolens subsp. suaveolens var. suaveolens ) and one subspecies ( G. suaveolens subsp. usambaricum ). The taxonomic status of specimens collected in São Tomé and Príncipe remains inconclusive, partly due to the limited fertile material available. Our study highlights the strength of combining morphological and population genetics data for discovering new taxa. Guidelines for using genetic clustering approaches in species delimitation are provided.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,233
Score d'incertitude au seuil0,420

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,184
Écart entre enseignants0,150 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle