Altered expression of cell adhesion genes and hybrid male sterility between subspecies of <i>Drosophila pseudoobscura</i>
Notice bibliographique
Résumé
Drosophila pseudoobscura pseudoobscura and Drosophila pseudoobscura bogotana are two closely related subspecies with incomplete reproductive isolation. A genome-wide comparison of expression in hybrids relative to parental subspecies has been previously used to identify genes with significant changes in expression uniquely associated with the sterile condition. The misexpression (i.e., gene expression beyond levels found in parentals) of such genes could be directly linked to the onset of sterility or could alternatively be caused by incompatibilities in a hybrid genome without a direct link to sterility. Cell adhesion was previously found to be one of the largest gene ontologies with changes in expression linked to sterility. Here we used gene expression assays in fertile backcross male progeny, along with introgression progeny in which we swap a major hybrid male sterility (HMS) allele, to generate fertile and sterile males genotypically similar to F1 sterile hybrids. We identify a cell adhesion gene (GA10921) whose change in expression is directly linked to sterility and modulated by a previously characterized HMS protein. GA10921 adds to our rather limited knowledge of changes in gene expression associated with HMS, and to the identification of gene interacting partners linked to HMS.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».