Taxonomic survey of Agaricomycetes (Fungi: Basidiomycota) in Ontario tallgrass prairies determined by fruiting body and soil rDNA sampling
Notice bibliographique
Résumé
The fungal composition of North America’s grasslands is poorly known, but an important area of study due to grassland conservation concerns and their close relation to agricultural lands. This study is a survey of Agaricomcyetes from fifteen diverse tallgrass prairies across southwestern Ontario, determined through fruiting body surveys (above-ground) and next-generation sequencing of soil ribosomal DNA (below-ground), and compares the results of these two techniques. The most species rich taxa were the Clavariaceae, Hygrophoraceae, and Entolomataceae, each detected by both techniques, with the addition of the Sebacinaceae and Polyporaceae sensu lato below-ground, and Hymenogastraceae (Hebeloma spp.) and Mycenaceae above-ground. Many of the most abundant species belonged to these species-rich taxa and were highly abundant by either technique. The above-ground surveys found at least 73 species and the below-ground technique 238 operatonal taxonomic units. Although many fine-scale taxa (species and approximate families) were unique to one technique or the other (only eight genetic species were shared between both), the below-ground technique uncovered a greater breadth of higher taxa (mostly equivalent to orders), including ones undetected by the above-ground technique. A review of grassland fungi surveys around the world shows many similarities and the potential for grassland fungal conservation in North America. Given current technological advancements and grassland conservation concerns, it is prudent to further study North America’s grassland fungi.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».