Resolving intergeneric relationships in the aervoid clade and the backbone of <i>Ptilotus</i> (Amaranthaceae): Evidence from whole plastid genomes and morphology
Notice bibliographique
Résumé
The informally named “aervoid clade” in Amaranthaceae includes ~134 species in five genera: Ptilotus (~120 spp.), Aerva (11 spp.) and the monotypic Nothosaerva , Omegandra , and Kelita . The relationships of the small aervoid genera to the large genus Ptilotus , and relationships between major clades within Ptilotus , are poorly resolved. The aims of this study were to: (1) elucidate relationships between genera and within Ptilotus using a phylogenomic approach; (2) identify morphological characters within each genus to help delimit generic boundaries; and (3) provide an updated taxonomic framework for the aervoids. A well‐supported coding DNA sequence (CDS) phylogeny was constructed for 36 aervoid and 5 outgroup species based on 69 gene sequences derived from assembled whole‐plastid genomes. The CDS tree was used to constrain relationships on a larger phylogeny based on Sanger‐sequenced ITS and matK for 135 taxa, comprising near‐comprehensive sampling within the aervoids. Both datasets were analysed using maximum likelihood and Bayesian inference. Morphological characters were assessed from herbarium specimens. Our study demonstrates that Aerva is polyphyletic; this is resolved by reinstating Ouret and erecting a new genus, Paraerva . Kelita is found to be deeply nested within Ptilotus and is formally synonymised. The well‐resolved phylogeny of Ptilotus presented here will inform future studies in biogeography and character evolution. A taxonomic treatment is provided for all aervoid genera, and new combinations are made.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».