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Enregistrement W2961708119 · doi:10.1101/680090

Coordination of Tissue Cell Polarity by Auxin Transport and Signaling

2019· preprint· en· W2961708119 sur OpenAlexafffund
Carla Verna, Sree Janani Ravichandran, Megan G. Sawchuk, Nguyễn Mạnh Linh, Enrico Scarpella

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Alberta
Mots-clésAuxinPolarity (international relations)Cell biologyCell polarityMulticellular organismBiologyIntracellularCellPolar auxin transportChemistryArabidopsisBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Coordination of polarity between cells in tissues is key to multicellular organism development. In animals, coordination of this tissue cell polarity often requires direct cell-cell interactions and cell movements, which are precluded in plants by a wall that separates cells and holds them in place; yet plants coordinate the polarity of hundreds of cells during the formation of the veins in their leaves. Overwhelming experimental evidence suggests that the plant signaling molecule auxin coordinates tissue cell polarity to induce vein formation, but how auxin does so is unclear. The prevailing hypothesis proposes that GNOM, a regulator of vesicle formation during protein trafficking, positions auxin transporters of the PIN-FORMED family to the correct side of the plasma membrane. The resulting cell-to-cell, polar transport of auxin would coordinate tissue cell polarity and would induce vein formation. Here we tested this hypothesis by means of a combination of cellular imaging, molecular genetic analysis, and chemical induction and inhibition. Contrary to predictions of the hypothesis, we find that auxin-induced vein formation occurs in the absence of PIN-FORMED proteins or any known intercellular auxin transporter, that the residual auxin-transport-independent vein-patterning activity relies on auxin signaling, and that a GNOM -dependent signal that coordinates tissue cell polarity to induce vein formation acts upstream of both auxin transport and signaling. Our results reveal synergism between auxin transport and signaling, and their unsuspected control by GNOM , in the coordination of tissue cell polarity during vein patterning, one of the most spectacular and informative expressions of tissue cell polarization in plants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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