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Enregistrement W2961787524 · doi:10.3389/fmicb.2019.01566

Regulation of the Phytoplankton Heme b Iron Pool During the North Atlantic Spring Bloom

2019· article· en· W2961787524 sur OpenAlexafffundabout
Evangelia Louropoulou, Martha Gledhill, Thomas J. Browning, Dhwani Desai, Jan‐Lukas Menzel Barraqueta, Manon Tonnard, Géraldine Sarthou, Hélène Planquette, Andrew R. Bowie, Ruth A. Schmitz, Julie LaRoche, Eric P. Achterberg

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Microbiology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine and coastal ecosystems
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaOcean Frontier InstituteCentre National de la Recherche ScientifiqueAgence Nationale de la RechercheInstitut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer
Mots-clésSpring bloomPhytoplanktonBloomSpring (device)OceanographyAlgal bloomHemeBiologyEcologyEnvironmental scienceFisheryGeologyNutrientBiochemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Heme b is an iron-containing co-factor in hemoproteins. Heme b concentrations are low (0.7 μm) from the North Atlantic Ocean (GEOVIDE cruise - GEOTRACES section GA01), which spanned several biogeochemical regimes. We examined the relationship between heme b abundance and the microbial community composition, and its utility for mapping iron limited phytoplankton. Heme b concentrations ranged from 0.16 to 5.1 pmol L-1 (median=2.0 pmol L-1, n=62) in the surface mixed layer (SML) along the cruise track, driven mainly by variability in biomass. However, in the Irminger Basin, the lowest heme b levels (SML: median=0.53 pmol L-1, n=12) were observed, whilst the biomass was highest (particulate organic carbon, median= 14.2 μmol L-1, n=25; chlorophyll a: median= 2.0 nmol L-1, n=23) pointing to regulatory mechanisms of the heme b pool for growth conservation. Dissolved iron (DFe) was not depleted (SML: median= 0.38 nmol L-1, n=11) in the Irminger Basin, but large diatoms (Rhizosolenia sp.) dominated. Hence, heme b depletion and regulation is likely to occur during bloom progression when phytoplankton class-dependent absolute iron requirements exceed the available ambient concentration of DFe. Furthermore, high heme b concentrations found in the Iceland Basin and Labrador Sea (median= 3.4 pmol L-1, n=20), despite having similar DFe concentrations to the Irminger Basin, were attributed to an earlier growth phase of the extant phytoplankton populations. Thus, heme b provides a snapshot of the cellular activity in situ and could both be used as indicator of iron limitation and contribute to understanding phytoplankton adaptation mechanisms to changing iron supplies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,025
Score d'incertitude au seuil0,049

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,149
Écart entre enseignants0,146 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2019
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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