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Enregistrement W2961890461 · doi:10.1073/pnas.1907646116

Assessing micrometastases as a target for nanoparticles using 3D microscopy and machine learning

2019· article· en· W2961890461 sur OpenAlexafffund
Benjamin R. Kingston, Abdullah M. Syed, Jessica Ngai, Shrey Sindhwani, Warren C. W. Chan

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Cells and Metastasis
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMicrometastasisNanoparticleMedicineWorkflowCancerMetastasisComputer sciencePathologyBiomedical engineeringNanotechnologyInternal medicineMaterials science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Metastasis of solid tumors is a key determinant of cancer patient survival. Targeting micrometastases using nanoparticles could offer a way to stop metastatic tumor growth before it causes excessive patient morbidity. However, nanoparticle delivery to micrometastases is difficult to investigate because micrometastases are small in size and lie deep within tissues. Here, we developed an imaging and image analysis workflow to analyze nanoparticle-cell interactions in metastatic tumors. This technique combines tissue clearing and 3D microscopy with machine learning-based image analysis to assess the physiology of micrometastases with single-cell resolution and quantify the delivery of nanoparticles within them. We show that nanoparticles access a higher proportion of cells in micrometastases (50% nanoparticle-positive cells) compared with primary tumors (17% nanoparticle-positive cells) because they reside close to blood vessels and require a small diffusion distance to reach all tumor cells. Furthermore, the high-throughput nature of our image analysis workflow allowed us to profile the physiology and nanoparticle delivery of 1,301 micrometastases. This enabled us to use machine learning-based modeling to predict nanoparticle delivery to individual micrometastases based on their physiology. Our imaging method allows researchers to measure nanoparticle delivery to micrometastases and highlights an opportunity to target micrometastases with nanoparticles. The development of models to predict nanoparticle delivery based on micrometastasis physiology could enable personalized treatments based on the specific physiology of a patient's micrometastases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,040
Score d'incertitude au seuil0,205

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,071
Tête enseignante GPT0,369
Écart entre enseignants0,298 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations96
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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