<sup>19</sup>F NMR Monitoring of Reversible Protein Post‐Translational Modifications: Class D β‐Lactamase Carbamylation and Inhibition
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Bacterial production of β‐lactamases with carbapenemase activity is a global health threat. The active sites of class D carbapenemases such as OXA‐48, which is of major clinical importance, uniquely contain a carbamylated lysine residue which is essential for catalysis. Although there is significant interest in characterizing this post‐translational modification, and it is a promising inhibition target, protein carbamylation is challenging to monitor in solution. We report the use of 19F NMR spectroscopy to monitor the carbamylation state of 19F‐labelled OXA‐48. This method was used to investigate the interactions of OXA‐48 with clinically used serine β‐lactamase inhibitors, including avibactam and vaborbactam. Crystallographic studies on 19F‐labelled OXA‐48 provide a structural rationale for the sensitivity of the 19F label to active site interactions. The overall results demonstrate the use of 19F NMR to monitor reversible covalent post‐translational modifications.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».