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Enregistrement W2962105967 · doi:10.1002/ana.25524

<i>PDXK</i> mutations cause polyneuropathy responsive to pyridoxal 5′‐phosphate supplementation

2019· article· en· W2962105967 sur OpenAlexafffund
Viorica Chelban, Matthew P. Wilson, Jodi Warman‐Chardon, Jana Vandrovcová, M. Natalia Zanetti, Eleni Zamba‐Papanicolaou, Stéphanie Efthymiou, Simon Pope, Maria R. Conte, Giancarlo Abis, Yo‐Tsen Liu, Eloise Tribollet, Nourelhoda A. Haridy, Juan A. Botía, Mina Ryten, Paschalis Nicolaou, Anna Minaidou, Kyproula Christodoulou, Kristin D. Kernohan, Alison Eaton, Matthew Osmond, Yoko Ito, Pierre R. Bourque, James E.C. Jepson, Oscar D. Bello, Fion Bremner, Carla Cordivari, Mary M. Reilly, Martha Foiani, Amanda Heslegrave, Henrik Zetterberg, Simon Heales, Nicholas Wood, James E. Rothman, Kym M Boycott, Philippa B. Mills, Peter T. Clayton, Henry Houlden

Notice bibliographique

RevueAnnals of Neurology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueHereditary Neurological Disorders
Établissements canadiensNewborn Screening OntarioOttawa HospitalChildren's Hospital of Eastern OntarioUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchRosetrees TrustUniversity College LondonGreat Ormond Street Hospital for ChildrenKing's College LondonGenome British ColumbiaOntario Genomics InstituteBrain Research UKGenome AlbertaAtaxia UKNational Institute for Health and Care ResearchOntario GenomicsNIHR Biomedical Research Centre, Royal Marsden NHS Foundation Trust/Institute of Cancer ResearchGenome CanadaMuscular Dystrophy UKWellcome Trust
Mots-clésPolyneuropathyCompound heterozygosityEnzyme replacement therapyBiologyPyridoxalB vitaminsBiochemistryMutationMedicineGeneticsInternal medicineGeneEndocrinologyEnzymeDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: To identify disease-causing variants in autosomal recessive axonal polyneuropathy with optic atrophy and provide targeted replacement therapy. METHODS: We performed genome-wide sequencing, homozygosity mapping, and segregation analysis for novel disease-causing gene discovery. We used circular dichroism to show secondary structure changes and isothermal titration calorimetry to investigate the impact of variants on adenosine triphosphate (ATP) binding. Pathogenicity was further supported by enzymatic assays and mass spectroscopy on recombinant protein, patient-derived fibroblasts, plasma, and erythrocytes. Response to supplementation was measured with clinical validated rating scales, electrophysiology, and biochemical quantification. RESULTS: We identified biallelic mutations in PDXK in 5 individuals from 2 unrelated families with primary axonal polyneuropathy and optic atrophy. The natural history of this disorder suggests that untreated, affected individuals become wheelchair-bound and blind. We identified conformational rearrangement in the mutant enzyme around the ATP-binding pocket. Low PDXK ATP binding resulted in decreased erythrocyte PDXK activity and low pyridoxal 5'-phosphate (PLP) concentrations. We rescued the clinical and biochemical profile with PLP supplementation in 1 family, improvement in power, pain, and fatigue contributing to patients regaining their ability to walk independently during the first year of PLP normalization. INTERPRETATION: is a cofactor in diverse essential biological pathways, our findings may have direct implications for neuropathies of unknown etiology characterized by reduced PLP levels. ANN NEUROL 2019;86:225-240.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,078
Tête enseignante GPT0,345
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations75
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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