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Enregistrement W2962649098 · doi:10.1126/scitranslmed.aav4772

A multimodality test to guide the management of patients with a pancreatic cyst

2019· article· en· W2962649098 sur OpenAlexaff
Simeon Springer, David L. Masica, Marco Dal Molin, Christopher Douville, Christopher J. Thoburn, Bahman Afsari, Lu Li, Joshua D. Cohen, Elizabeth D. Thompson, Peter J. Allen, David S. Klimstra, Mark Schattner, C. Max Schmidt, Michele Yip-Schneider, Rachel E. Simpson, Carlos Fernández-del Castillo, Mari Mino–Kenudson, William R. Brugge, Randall E. Brand, Aatur D. Singhi, Aldo Scarpa, Rita T. Lawlor, Roberto Salvia, Giuseppe Zamboni, Seung‐Mo Hong, Dae Wook Hwang, Jin‐Young Jang, Wooil Kwon, Niall Swan, Justin Geoghegan, Massimo Falconi, Stefano Crippa, Claudio Doglioni, Jorge Paulino, Richard D. Schulick, Barish H. Edil, Walter G. Park, Shinichi Yachida, Susumu Hijioka, Jeanin E. van Hooft, Jin He, Matthew J. Weiss, Richard A. Burkhart, Martin A. Makary, Marcia Irene Canto, Michael Goggins, Janine Ptak, Lisa Dobbyn, Joy Schaefer, Natalie Sillman, Maria Popoli, Alison P. Klein, Cristian Tomasetti, Rachel Karchin, Nickolas Papadopoulos, Kenneth W. Kinzler, Bert Vogelstein, Christopher L. Wolfgang, Ralph H. Hruban, Anne Marie Lennon

Notice bibliographique

RevueScience Translational Medicine · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic and Hepatic Oncology Research
Établissements canadiensPancreas Centre (Canada)
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Cancer InstituteLudwig Center at HarvardNational Institutes of HealthJohns Hopkins UniversityVirginia and D.K. Ludwig Fund for Cancer ResearchLustgarten FoundationJohn Templeton Foundation
Mots-clésMedicineGold standard (test)HistopathologyCystPancreatic cancerPancreatic cystRadiologyCohortGeneral surgerySurgeryIntensive care medicinePathologyInternal medicineCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pancreatic cysts are common and often pose a management dilemma, because some cysts are precancerous, whereas others have little risk of developing into invasive cancers. We used supervised machine learning techniques to develop a comprehensive test, CompCyst, to guide the management of patients with pancreatic cysts. The test is based on selected clinical features, imaging characteristics, and cyst fluid genetic and biochemical markers. Using data from 436 patients with pancreatic cysts, we trained CompCyst to classify patients as those who required surgery, those who should be routinely monitored, and those who did not require further surveillance. We then tested CompCyst in an independent cohort of 426 patients, with histopathology used as the gold standard. We found that clinical management informed by the CompCyst test was more accurate than the management dictated by conventional clinical and imaging criteria alone. Application of the CompCyst test would have spared surgery in more than half of the patients who underwent unnecessary resection of their cysts. CompCyst therefore has the potential to reduce the patient morbidity and economic costs associated with current standard-of-care pancreatic cyst management practices.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,348
Écart entre enseignants0,326 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations207
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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