Estimate of the reproduction number of the 2015 Zika virus outbreak in Barranquilla, Colombia, and estimation of the relative role of sexual transmission
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Notice bibliographique
Résumé
abstract: Background\nIn 2015, the Zika arbovirus (ZIKV) began circulating in the Americas, rapidly expanding its global geographic range in explosive outbreaks. Unusual among mosquito-borne diseases, ZIKV has been shown to also be sexually transmitted, although sustained autochthonous transmission due to sexual transmission alone has not been observed, indicating the reproduction number (R0) for sexual transmission alone is less than 1. Critical to the assessment of outbreak risk, estimation of the potential attack rates, and assessment of control measures, are estimates of the basic reproduction number, R0.\nMethods\nWe estimated the R0 of the 2015 ZIKV outbreak in Barranquilla, Colombia, through an analysis of the exponential rise in clinically identified ZIKV cases (n = 359 to the end of November, 2015).\nFindings\nThe rate of exponential rise in cases was Ï = 0.076 days[superscript â1], with 95% CI [0.066,0.087] days[superscript â1]. We used a vector-borne disease model with additional direct transmission to estimate the R0; assuming the R0 of sexual transmission alone is less than 1, we estimated the total R0 = 3.8 [2.4,5.6], and that the fraction of cases due to sexual transmission was 0.23 [0.01,0.47] with 95% confidence.\nInterpretation\nThis is among the first estimates of R0 for a ZIKV outbreak in the Americas, and also among the first quantifications of the relative impact of sexual transmission.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle