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Enregistrement W2963000778 · doi:10.1096/fasebj.30.1_supplement.1209.1

Analysis of phosphorylation of the myosin targeting subunit of smooth muscle myosin light chain phosphatase by Phos‐tag SDS‐PAGE

2016· article· en· W2963000778 sur OpenAlexafffundabout
Michael P. Walsh, Justin A. MacDonald, Cindy Sutherland

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMuscle Physiology and Disorders
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésPhosphorylationMyosin-light-chain phosphataseMyosin light-chain kinasePhosphataseMyosinKinaseProtein subunitBiologyCell biologyProtein phosphorylationProtein kinase ABiochemistryChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Phosphorylation of the myosin targeting subunit (MYPT1) of myosin light chain phosphatase plays an important role in the regulation of smooth muscle contraction, and several sites of phosphorylation by different protein Ser/Thr kinases have been identified. Furthermore, in some instances, phosphorylation at specific sites affects phosphorylation at neighboring sites, with functional consequences. Characterization of the complex phosphorylation of MYPT1 in tissue samples at rest and in response to contractile and relaxant stimuli is, therefore, challenging. We have exploited Phos‐tag SDS‐PAGE in combination with western blotting using antibodies to MYPT1 to separate multiple phosphorylated MYPT1 species and quantify MYPT1 phosphorylation stoichiometry using purified, full‐length recombinant MYPT1 phosphorylated by Rho‐associated coiled‐coil kinase (ROCK) and cyclic AMP‐dependent protein kinase (PKA). This approach confirmed that phosphorylation of MYPT1 by ROCK occurs at Thr697 and Thr855, PKA phosphorylates these two sites and the neighboring Ser696 and Ser854, and prior phosphorylation at Thr697 and Thr855 by ROCK precludes phosphorylation at Ser696 and Ser854 by PKA. Furthermore, phosphorylation at Thr697 and Thr855 by ROCK exposes two other sites of phosphorylation by PKA. Treatment of Triton‐skinned rat caudal arterial smooth muscle strips with the membrane‐impermeant phosphatase inhibitor microcystin, or of intact tissue with the membrane‐permeant calyculin A, induced slow, sustained contractions that correlated with phosphorylation of MYPT1 at 7 to ≥10 sites. Phos‐tag SDS‐PAGE thus provides a suitable and convenient method for analysis of the complex, multi‐site MYPT1 phosphorylation events involved in the regulation of myosin light chain phosphatase activity and smooth muscle contraction. Support or Funding Information Funded by the Canadian Institutes of Health Research (MOP‐111262)

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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