Post-translational Regulatory Mechanisms Acting on KLF4 Mediate Pluripotency Exit in Naïve Mouse Embryonic Stem Cells
Notice bibliographique
Résumé
Pluripotent embryonic stem (ES) cells have the potential to self-renew and differentiate to generate all adult tissues. Pluripotency is regulated by an interconnected network of transcription factors including OCT4, SOX2, NANOG and KLF4. This transcriptional network is integrated with extracellular signaling pathways regulating pluripotency and differentiation. Mouse ES cells can be maintained in a state known as naïve pluripotency by culture in leukemia inhibitory factor (LIF) and two signaling pathway inhibitors (LIF/2i). A previous study observed that a reduction in Klf4 transcript, due to LIF withdrawal, was the first change in pluripotency gene expression during differentiation. Based on this finding I hypothesized that removal of KLF4 protein from transcriptional network would be required for exit from pluripotency. To investigate this I examined the levels of pluripotency associated transcription factors in the nucleus of ES cells as they exit the pluripotent state. This investigation revealed that a reduction in KLF4 protein levels did not occur immediately following the reduction in Klf4 transcription; instead I identified nuclear export of KLF4 protein was required for the reduction in Klf4 transcription and pluripotency exit. Next, I investigated Klf4 gene and protein regulation and found that LIF/2i maintains Klf4 expression through both transcriptional and post-translational mechanisms. Specifically, KLF4 protein is highly stable in LIF/2i and this stability is maintained by physical interaction with active transcriptional complexes which ensure nuclear anchoring of the KLF4 protein. Surprisingly, KLF4 protein stability is so high (t½ >24 hr) that protein levels change by
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».