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Enregistrement W2963888718 · doi:10.1093/ckj/sfz085

Performance of soluble Klotho assays in clinical samples of kidney disease

2019· article· en· W2963888718 sur OpenAlexaff
Javier A. Neyra, Orson W. Moe, Johanne Pastor, Fabiola Gianella, Sachdev S. Sidhu, Mark J. Sarnak, Joachim H. Ix, David A. Drew

Notice bibliographique

RevueClinical Kidney Journal · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParathyroid Disorders and Treatments
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Institutes of Health
Mots-clésKlothoMedicineKidney diseaseKidneyInternal medicineBioinformaticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Soluble Klotho has multiple systemic salutary effects. In animals, both acute and chronic kidney disease models display systemic Klotho deficiency. As such, there is considerable interest in investigating soluble Klotho as a biomarker in patients with different types and severity of kidney diseases. Unfortunately, there remains uncertainty regarding the best method to measure soluble Klotho in human serum samples. METHODS: Using human serum samples obtained from several clinical cohorts with a wide range of kidney function, we measured soluble Klotho using a commercial enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) as well as with an immunoprecipitation-immunoblot (IP-IB) assay utilizing a synthetic antibody with high affinity and specificity for Klotho. Recovery of spiking with a known amount of exogenous Klotho was tested. A subset of samples was analyzed with and without the addition of a protease inhibitor cocktail at the time of collection or after the first freeze-thaw cycle to determine if these maneuvers influenced performance. RESULTS: = 0.18, P = 0.12). Use of a protease inhibitor cocktail neither improved nor impaired performance of the IP-IB assay; however, subsequent freeze-thaw cycle resulted in a significant reduction in Klotho recovery and dissipated the correlation between Klotho levels and eGFR. With the ELISA, the use of protease inhibitor cocktail resulted in an increase in intrasubject variability. CONCLUSIONS: The IP-IB assay is preferable to the commercial ELISA to measure soluble Klotho concentrations in never-thawed serum samples of humans with varying severity of kidney disease. However, due to the labor-intensive nature of the IP-IB assay, further research is needed to secure an assay suitable for high-throughput work.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,031

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,062
Tête enseignante GPT0,388
Écart entre enseignants0,326 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations63
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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