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Enregistrement W2963974185 · doi:10.1002/jmd2.12064

Transiently elevated plasma methionine, <i>S</i>‐adenosylmethionine and <i>S</i>‐adenosylhomocysteine: Unreported laboratory findings in a patient with NGLY1 deficiency, a congenital disorder of deglycosylation

2019· article· en· W2963974185 sur OpenAlexaff
Caitlin A. Chang, Xing‐Chang Wei, Steven R. Martin, David S. Sinasac, Walla Al‐Hertani

Notice bibliographique

RevueJIMD Reports · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Neurodevelopmental Disorders
Établissements canadiensAlberta Children's HospitalUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInborn error of metabolismCystathionine beta synthaseMethionineHypotoniaInternal medicineEndocrinologyHomocysteineHomocystinuriaMedicineExonMicrocephalyBiologyGeneticsPediatricsGeneAmino acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract We report on a 5‐year‐old female born to consanguineous parents, ascertained at the age of 23 months for an elevated plasma methionine level, a mildly abnormal total plasma homocysteine (tHcy), and elevated aminotransferases. She had global developmental delay, microcephaly, dysmorphic facial features, hypotonia, nystagmus and tremor in her upper extremities. Metabolic investigations demonstrated elevations in plasma methionine, plasma S ‐adenosylmethionine (SAM) and plasma S ‐adenosylhomocysteine (SAH), with normal urine adenosine levels. Some of the elevations persisted for over 1 year. Sequencing of the ADK and AHCY genes was negative for causative variants. Plasma methionine normalized 1 year after ascertainment, but SAM and SAH continued to be elevated for six more months before normalization, and aminotransferases remained mildly elevated. Whole exome sequencing demonstrated a homozygous pathogenic variant; NM_018297.3(NGLY1):c.1405C&gt;T (p.Arg469*) in exon 9 of the NGLY1 gene, for which both parents were heterozygous. To our knowledge, this is the first report of NGLY1 deficiency with elevations in plasma methionine, SAM and SAH and a slight elevation of tHcy. Less than 20 patients have been reported with NGLY1 deficiency worldwide and this case expands on the biochemical phenotype of this newly discovered inborn error of metabolism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,143
Score d'incertitude au seuil0,970

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,190
Écart entre enseignants0,187 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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