MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2964060040 · doi:10.1101/712521

Regulation of thymocyte β-selection, development and positive selection by glycogen synthase kinase-3

2019· preprint· en· W2964060040 sur OpenAlexaff
Satish Patel, Bradley W. Doble, Pamela S. Ohashi, James R. Woodgett

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueWnt/β-catenin signaling in development and cancer
Établissements canadiensUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer ResearchMount Sinai HospitalLunenfeld-Tanenbaum Research InstitutePrincess Margaret Cancer CentreUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésThymocyteGSK-3BiologyDouble negativeNegative selectionT-cell receptorCD8Cell biologyWnt signaling pathwayKinaseMolecular biologyT cellSignal transductionImmunologyBiochemistryGeneAntigenImmune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Glycogen synthase kinase-3 (GSK-3) is a ubiquitously expressed serine/threonine kinase, that exists as two isoforms in mammals, GSK-3α and GSK-3β, that are key downstream mediators of the phosphatidylinositol 3’ kinase, Wnt, Notch and other pathways. Here, we report that simultaneous inactivation of both GSK-3α and GSK-3β during early thymocyte ontogeny has profound effects on both β-selection and positive selection, key checkpoints essential to producing functionally mature αβ T cells. Conditional GSK-3α/β knockout animals (LckCre + GSK-3αβ fl/fl ) possessed pre-double positive (pre-DP) thymocytes (CD4 − CD8 − CD117 − CD25 − ) with compromised TCRβ chain expression along with elevated levels of β-catenin and reduced Notch activity. β-selection was impaired allowing pre-DP thymocytes to differentiate to DP thymocytes (CD4 + CD8 + ) while bypassing strict requirements for productive TCRβ chain rearrangements and functional expression. Also impaired was the requisite pre-TCR and Notch-mediated expansion that normally precedes differentiation to the DP stage. Consequently, LckCre + GSK-3αβ fl/fl mice initially generated fewer DP thymocytes that expressed significantly reduced levels of mature TCR. The aberrant DP thymocytes expressed high levels of the pro-survival Bcl-2 family member Mcl-1, failed positive selection and accumulated as CD4 hi CD8 lo positive selection intermediates resulting in loss of both mature CD4 and CD8 lineages. LckCre + GSK-3αβ fl/fl mice succumbed to oligoclonal peripheral lymphomas with high penetrance. These data reveal essential roles for GSK-3 in several checkpoints of early T cell development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,203
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)→Même sujetWnt/β-catenin signaling in development and cancer→Travaux en français237 207→