MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2964200538 · doi:10.1002/jimd.12156

Clinical presentation and proteomic signature of patients with <i>TANGO2</i> mutations

2019· article· en· W2964200538 sur OpenAlexafffund
Nadja Mingirulli, Angela Pyle, Denisa Hathazi, Charlotte L. Alston, Nicolai Kohlschmidt, Gina O’Grady, Leigh B. Waddell, Frances J. Evesson, Sandra B. T. Cooper, Christian Turner, Jennifer Duff, Ana Töpf, Dèlia Yubero, Cristina Jou, A. Nascimento, C. Ortez, Àngels García‐Cazorla, Claudia Groß, María del Mar O’Callaghan, Saikat Santra, M A Preece, Michael Champion, Sergei Korenev, Efsthatia Chronopoulou, Anirban Majumdar, Germaine Pierre, Daniel McArthur, Kyle Thompson, Plácido Navas, Antònia Ribes, Frederic Tort, Agatha Schlüter, Aurora Pujol, Raquel Montero, Georgia Sarquella‐Brugada, Hanns Lochmüller, C. Jimenez‐Mallebrera, Robert W. Taylor, Rafael Artuch, Janbernd Kirschner, Sarah C. Grünert, Andreas Roos, Rita Horváth

Notice bibliographique

RevueJournal of Inherited Metabolic Disease · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensOttawa HospitalChildren's Hospital of Eastern OntarioUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesEuropean Research CouncilGeneralitat de CatalunyaInstituto de Salud Carlos IIINational Institute for Health and Care ResearchWellcome TrustFrench Muscular Dystrophy AssociationMedical Research Council CanadaNewton FundMedical Research CouncilUniversity of Kentucky
Mots-clésBiologyRespiratory chainLactic acidosisMitochondrial respiratory chainCytochrome c oxidaseCompound heterozygosityPhenotypeInternal medicineEndocrinologyMitochondrionMolecular biologyGeneticsGeneMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Transport And Golgi Organization protein 2 (TANGO2) deficiency has recently been identified as a rare metabolic disorder with a distinct clinical and biochemical phenotype of recurrent metabolic crises, hypoglycemia, lactic acidosis, rhabdomyolysis, arrhythmias, and encephalopathy with cognitive decline. We report nine subjects from seven independent families, and we studied muscle histology, respiratory chain enzyme activities in skeletal muscle and proteomic signature of fibroblasts. All nine subjects carried autosomal recessive TANGO2 mutations. Two carried the reported deletion of exons 3 to 9, one homozygous, one heterozygous with a 22q11.21 microdeletion inherited in trans . The other subjects carried three novel homozygous (c.262C>T/p.Arg88*; c.220A>C/p.Thr74Pro; c.380+1G>A), and two further novel heterozygous (c.6_9del/p.Phe6del); c.11‐13delTCT/p.Phe5del mutations. Immunoblot analysis detected a significant decrease of TANGO2 protein. Muscle histology showed mild variation of fiber diameter, no ragged‐red/cytochrome c oxidase‐negative fibers and a defect of multiple respiratory chain enzymes and coenzyme Q 10 (CoQ 10 ) in two cases, suggesting a possible secondary defect of oxidative phosphorylation. Proteomic analysis in fibroblasts revealed significant changes in components of the mitochondrial fatty acid oxidation, plasma membrane, endoplasmic reticulum‐Golgi network and secretory pathways. Clinical presentation of TANGO2 mutations is homogeneous and clinically recognizable. The hemizygous mutations in two patients suggest that some mutations leading to allele loss are difficult to detect. A combined defect of the respiratory chain enzymes and CoQ 10 with altered levels of several membrane proteins provides molecular insights into the underlying pathophysiology and may guide rational new therapeutic interventions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations62
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Inherited Metabolic DiseaseMême sujetMitochondrial Function and PathologyTravaux en français237 207