p53, Mismatch Repair Protein, and POLE Abnormalities in Ovarian Clear Cell Carcinoma
Notice bibliographique
Résumé
The PROMISE diagnostic algorithm, which uses p53, mismatch repair (MMR) protein immunohistochemistry, and DNA polymerase ε (POLE) exonuclease domain mutation testing, is a reliable surrogate of the molecular group in endometrial carcinoma. Its prognostic value has been validated in endometrial carcinoma and ovarian endometrioid carcinoma. Moreover, a similar prognostic grouping has been recently documented in endometrial clear cell carcinoma. Thus, we aimed to explore the role of these markers in ovarian clear cell carcinoma, another endometriosis-associated malignancy. A total of 90 cases were identified and confirmed after secondary review. Immunohistochemistry for p53, MLH1, MSH2, MSH6, and PMS2 was performed in formalin-fixed, paraffin-embedded tissue. POLE mutational analysis was performed in 47 cases. Results were correlated with clinicopathologic variables including disease-free survival (DFS), overall survival, and disease-specific survival (DSS). Endometriosis was found in 67 (74%) cases. Six (7%) tumors were p53 abnormal, 82 (91%) were p53 normal, and 2 (2%) tumors had MMR deficiency (1 MSH6 loss and 1 MSH2/6 loss; both were p53 normal). Several POLE variants of unknown significance were detected, but no pathogenic mutations. The mean follow-up period was 43 months (median: 34, range: 1 to 189). Abnormal p53 status was associated with advanced Federation of Gynecology and Obstetrics stage, lymph node metastases, DFS and DSS (P<0.05, Fisher exact test). In univariate analysis, abnormal p53 and positive lymph node status had worse DFS, whereas bilaterality, surface involvement, and advanced stage were associated with worse DFS, overall survival and DSS (P<0.05, Cox regression). On multivariate analysis, only stage retained statistical association with survival. Using a molecular-based approach designed for endometrial carcinoma, most ovarian clear cell carcinomas fall into the copy-number-low molecular subgroup. However, a small but important subset has an abnormal p53 expression (copy-number-high group). This subset is associated with adverse features including extrapelvic disease, nodal metastases, and recurrence similar to endometrial and ovarian endometrioid cancer. Thus, testing for this marker has potential prognostic significance. The role of other markers in the PROMISE algorithm remains to be elucidated, as we found a low frequency of MMR abnormalities and no pathogenic POLE mutations in our series.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».