Attack and Defense in Cellular Decision-Making: Lessons from Machine Learning
Notice bibliographique
Résumé
Machine-learning algorithms can be fooled by small well-designed adversarial perturbations.This is reminiscent of cellular decision-making where ligands (called antagonists) prevent correct signaling, like in early immune recognition.We draw a formal analogy between neural networks used in machine learning and models of cellular decision-making (adaptive proofreading).We apply attacks from machine learning to simple decision-making models and show explicitly the correspondence to antagonism by weakly bound ligands.Such antagonism is absent in more nonlinear models, which inspires us to implement a biomimetic defense in neural networks filtering out adversarial perturbations.We then apply a gradient-descent approach from machine learning to different cellular decision-making models, and we reveal the existence of two regimes characterized by the presence or absence of a critical point for the gradient.This critical point causes the strongest antagonists to lie close to the decision boundary.This is validated in the loss landscapes of robust neural networks and cellular decisionmaking models, and observed experimentally for immune cells.For both regimes, we explain how associated defense mechanisms shape the geometry of the loss landscape and why different adversarial attacks are effective in different regimes.Our work connects evolved cellular decision-making to machine learning and motivates the design of a general theory of adversarial perturbations, both for in vivo and in silico systems.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,009 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,005 |
| Communication savante | 0,002 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».