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Enregistrement W2964483659 · doi:10.1038/s41436-019-0620-0

The development of the Clinician-reported Genetic testing Utility InDEx (C-GUIDE): a novel strategy for measuring the clinical utility of genetic testing

2019· article· en· W2964483659 sur OpenAlexafffund
Robin Z. Hayeems, Stephanie Luca, Wendy J. Ungar, Ayushi Bhatt, Lauren Chad, Eleanor Pullenayegum, M. Stephen Meyn

Notice bibliographique

RevueGenetics in Medicine · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensInstitute for Clinical Evaluative SciencesSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenPublic Health OntarioUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésGenetic testingPsychosocialSelection (genetic algorithm)Set (abstract data type)Content validityFace validityMedicineGenetic counselingReliability (semiconductor)Qualitative researchApplied psychologyPsychologyClinical psychologyPsychometricsComputer scienceGeneticsPsychiatryArtificial intelligence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Clinical utility describes a genetic test's value to patients, families, health-care providers, systems, or society. This study aims to define clinical utility from the perspective of clinicians and develop a novel outcome measure that operationalizes this concept. METHODS: Item selection for the Clinician-reported Genetic testing Utility InDEx (C-GUIDE) was informed by a scoping review of the literature. Item reduction was guided by qualitative and quantitative feedback from semistructured interviews and a cross-sectional survey of genetics and nongenetics specialists. Final item selection, index scoring, and structure were guided by feedback from an expert panel of genetics professionals. RESULTS: A review of 194 publications informed the selection of a preliminary set of 25 items. Feedback from 35 semistructured interviews, 113 surveys, and 11 expert panelists informed the content and wording of C-GUIDE's final set of 18 items that reflect on the utility of testing related to diagnosis, management, and familial/psychosocial impact. C-GUIDE achieves content and face validity for use in a range of diagnostic genetic testing settings. CONCLUSION: Work to establish reliability and construct validity is underway. C-GUIDE will be useful in comparative studies to generate policy-relevant evidence pertaining to the clinical utility of genetic testing across a range of settings.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,030
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,104
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,030
Score d'incertitude au seuil0,157

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0300,104
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,003
Bibliométrie0,0090,008
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,191
Tête enseignante GPT0,405
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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