MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2964661406 · doi:10.1002/pca.2883

Metabolomics analysis and biological investigation of three Malvaceae plants

2019· article· en· W2964661406 sur OpenAlexaff
Omnia Hesham Abdelhafez, Eman M. Othman, John Refaat Fahim, Samar Yehia Desoukey, Sheila Marie Pimentel‐Elardo, Justin R. Nodwell, Tanja Schirmeister, Ahmed Tawfike, Usama Ramadan Abdelmohsen

Notice bibliographique

RevuePhytochemical Analysis · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensMaRSUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesMinia University
Mots-clésChemistryMalvaceaeMetabolomicsComputational biologyBotanyChromatography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Metabolomics is a fast growing technology that has effectively contributed to many plant-related sciences and drug discovery. OBJECTIVE: To use the non-targeted metabolomics approach to investigate the chemical profiles of three Malvaceae plants, namely Hibiscus mutabilis L. (Changing rose), H. schizopetalus (Dyer) Hook.f. (Coral Hibiscus), and Malvaviscus arboreus Cav. (Sleeping Hibiscus), along with evaluating their antioxidant and anti-infective potential. METHODOLOGY: Metabolic profiling was carried out using liquid chromatography coupled with high-resolution electrospray ionisation mass spectrometry (LC-HR-ESI-MS) for dereplication purposes. The chemical composition of the studied plants was further compared by principal component analysis (PCA). The antioxidant and anti-infective properties of their different extracts were correlated to their phytochemical profiles by orthogonal partial least square discriminant analysis (OPLS-DA). RESULTS: A variety of structurally different metabolites, mostly phenolics, were characterized. Comparing the distribution pattern of these tentatively identified metabolites among the studied plant species/fractions revealed the chemical uniqueness of the dichloromethane fraction of M. arboreus. Some extracts and fractions of these plants demonstrated noteworthy antioxidant and antitrypanosomal potential; the latter was partly attributed to their anti-protease activities. The active principles of these plants were pinpointed before any laborious isolation steps, to avoid the redundant isolation of previously known compounds. CONCLUSION: This study highlighted the use of the established procedure in exploring the metabolomes of these species, which could be helpful for chemotaxonomic and authentication purposes, and might expand the basis for their future phytochemical analysis. Coupling the observed biological potential with LC-MS data has also accelerated the tracing of their bioactive principles.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations159
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePhytochemical AnalysisMême sujetMetabolomics and Mass Spectrometry StudiesTravaux en français237 207