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Enregistrement W2964685394 · doi:10.1158/1538-7445.am2019-3698

Abstract 3698: Conditionally reprogrammed cells from patient-derived xenograft to model neuroendocrine prostate cancer development

2019· article· en· W2964685394 sur OpenAlexaff
Xinpei Ci, Jun Hao, Xin Dong, Hui Xue, Rebecca Wu, Anne Haegert, Colin C. Collins, Dong Lin, Yuzhuo Wang

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Treatment and Research
Établissements canadiensBC Cancer AgencySpinal Cord Injury BCUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTransdifferentiationProstate cancerCancer researchTranscriptomeAndrogen receptorLNCaPProstateBiologyCancerAdenocarcinomaIn vivoProgenitor cellStem cellGeneCell biologyGene expressionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Treatment-emergent neuroendocrine prostate cancer (t-NEPC) is a lethal subtype of advanced prostate cancer that occurs via NE transdifferentiation of prostate adenocarcinomas in response to androgen receptor (AR)-inhibition therapy. Study of t-NEPC has been hampered by a lack of clinically relevant models. We previously established a unique and first-in-field patient-derived xenograft (PDX) model of adenocarcinoma (LTL331)-to-NEPC (LTL331R) transdifferentiation. In this study, we established conditionally reprogrammed (CR) cells from the adenocarcinoma PDX tumor line LTL331. These LTL331-derived CR (LTL331-CR) cells retained the same genomic mutations of the parental tumor and, can be genetically manipulated and continuously propagated in vitro. Further androgen deprivation treatment on LTL331-CR cells showed no effect on cell proliferation. Transcriptomic analyses of the LTL331-CR cells revealed profound downregulation of androgen response pathway, and enrichment of stem/progenitor-like marker genes, compared with the parental tumor LTL331. Notably, when grafted back into the subrenal capsule of male NOD/SCID mice, these LTL331-CR cells gave rise to NEPC tumors directly as manifested by histological expression of NE markers. Transcriptomic analyses of the newly developed NEPC tumors also demonstrated marked enrichment of NEPC signature genes and loss of AR signaling genes. This study provides a novel strategy to investigate the mechanisms underlying t-NEPC development with a unique PDX by enabling gene manipulation ex vivo and subsequent functional evaluation in vivo. Citation Format: Xinpei Ci, Jun Hao, Xin Dong, Hui Xue, Rebecca Wu, Anne M. Haegert, Colin C. Collins, Dong Lin, Yuzhuo Wang. Conditionally reprogrammed cells from patient-derived xenograft to model neuroendocrine prostate cancer development [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2019; 2019 Mar 29-Apr 3; Atlanta, GA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2019;79(13 Suppl):Abstract nr 3698.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,072
Tête enseignante GPT0,394
Écart entre enseignants0,323 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
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