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Enregistrement W2964733322 · doi:10.1371/journal.pone.0220698

Analysis of the neurotoxin β-N-methylamino-L-alanine (BMAA) and isomers in surface water by FMOC derivatization liquid chromatography high resolution mass spectrometry

2019· article· en· W2964733322 sur OpenAlexafffundabout
Sung Vo Duy, Gabriel Munoz, Quoc Tuc Dinh, Dat Tien, Dana F. Simon, Sébastien Sauvé

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNational Research Council CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaFonds de recherche du QuébecGénome QuébecWilfrid Laurier UniversityGenome Canada
Mots-clésDerivatizationChloroformateChromatographyChemistryMass spectrometryDetection limitOrbitrapLiquid chromatography–mass spectrometryAqueous solutionOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The neurotoxin β-N-methylamino-L-alanine (BMAA), suspected to trigger neurodegenerative diseases, can be produced during cyanobacterial bloom events and subsequently affect ecosystems and water sources. Some of its isomers including β-amino-N-methylalanine (BAMA), N-(2-aminoethyl) glycine (AEG), and 2,4-diaminobutyric acid (DAB) may show different toxicities than BMAA. Here, we set out to provide a fast and sensitive method for the monitoring of AEG, BAMA, DAB and BMAA in surface waters. A procedure based on aqueous derivatization with 9-fluorenylmethyl chloroformate (FMOC-Cl) was investigated for this purpose. Under optimized conditions, a small aqueous sample aliquot (5 mL) was spiked with BMAA-d3 internal standard, subjected to FMOC-Cl derivatization, centrifuged, and analyzed. The high-throughput instrumental method (10 min per sample) involved on-line pre-concentration and desalting coupled to ultra-high-performance liquid chromatography high-resolution mass spectrometry (UHPLC-HRMS). Chromatographic gradient and mobile phases were adjusted to obtain suitable separation of the 4 isomers. The method limits of detection were in the range of 2-5 ng L-1. In-matrix validation parameters including linearity range, accuracy, precision, and matrix effects were assessed. The method was applied to surface water samples (n = 82) collected at a large spatial scale in lakes and rivers in Canada. DAB was found in >70% of samples at variable concentrations (<3-1,900 ng L-1), the highest concentrations corresponding to lake samples in cyanobacterial bloom periods. BMAA was only reported (110 ng L-1) at one HAB-impacted location. This is one of the first studies to report on the profiles of AEG, BAMA, DAB, and BMAA in background and impacted surface waters.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,193
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2019
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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