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Enregistrement W2964750218 · doi:10.1038/s42003-019-0537-9

A genome-wide association study identifies genetic loci associated with specific lobar brain volumes

2019· article· en· W2964750218 sur OpenAlexaff
Sven J. van der Lee, Maria J. Knol, Ganesh Chauhan, Claudia L. Satizábal, Albert V. Smith, Edith Hofer, Joshua C. Bis, Derrek P. Hibar, Saima Hilal, Erik B. van den Akker, Konstantinos Arfanakis, Manon Bernard, Lisa R. Yanek, Najaf Amin, Fabrice Crivello, Josh W. Cheung, Tamara B. Harris, Yasaman Saba, Oscar L. Lopez, Shuo Li, Jeroen van der Grond, Lei Yu, Tomáš Paus, Gennady V. Roshchupkin, Philippe Amouyel, Neda Jahanshad, Kent D. Taylor, Qiong Yang, Rasika A. Mathias, Stefan Böehringer, Bernard Mazoyer, Kenneth Rice, Ching‐Yu Cheng, Pauline Maillard, Tien Yin Wong, Wiro J. Niessen, Alexa Beiser, Marian Beekman, Wanting Zhao, Paul Nyquist, Christopher Chen, L. J. Launer, Bruce M. Psaty, Muhammad Ikram, Meike W. Vernooij, Helena Schmidt, Zdenka Pausová, Diane M. Becker, Philip L. De Jager, Paul M. Thompson, Cornelia M. van Duijn, David A. Bennett, P. Eline Slagboom, Reinhold Schmidt, W.T. Longstreth, M. Arfan Ikram, Sudha Seshadri, Stéphanie Debette, Vilmundur Guðnason, Hieab H.H. Adams, Charles DeCarli

Notice bibliographique

RevueCommunications Biology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensHolland Bloorview Kids Rehabilitation HospitalSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Center for Research ResourcesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Human Genome Research InstituteNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institute on AgingAgence Nationale de la RechercheAlzheimer's Disease Neuroimaging Initiative
Mots-clésBrain sizeOccipital lobeGenome-wide association studyBiologyParietal lobeTemporal lobeNeuroscienceFrontal lobeGenetic associationGeneticsSingle-nucleotide polymorphismGeneMedicineGenotypeEpilepsyMagnetic resonance imaging

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Brain lobar volumes are heritable but genetic studies are limited. We performed genome-wide association studies of frontal, occipital, parietal and temporal lobe volumes in 16,016 individuals, and replicated our findings in 8,789 individuals. We identified six genetic loci associated with specific lobar volumes independent of intracranial volume. Two loci, associated with occipital (6q22.32) and temporal lobe volume (12q14.3), were previously reported to associate with intracranial and hippocampal volume, respectively. We identified four loci previously unknown to affect brain volumes: 3q24 for parietal lobe volume, and 1q22, 4p16.3 and 14q23.1 for occipital lobe volume. The associated variants were located in regions enriched for histone modifications ( DAAM1 and THBS3 ), or close to genes causing Mendelian brain-related diseases ( ZIC4 and FGFRL1 ). No genetic overlap between lobar volumes and neurological or psychiatric diseases was observed. Our findings reveal part of the complex genetics underlying brain development and suggest a role for regulatory regions in determining brain volumes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,052
Score d'incertitude au seuil0,942

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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