Signal Crosstalk between Two Different Agrobacterium Two-Component Systems
Notice bibliographique
Résumé
Bacteria often use the so-called two-component system to transduce signal.A typical bacterial two-component system is comparatively simple and comprises two components, a sensor with histidine kinase activity and its cognate phosphorylatable response regulator [1,2].Most bacteria encode dozens of two-component signaling pathway [2].Although both the histidine kinase sensor and response regulator in each two-component system are part of large, paralogous protein families that are highly similar at both sequence and structural levels, relatively little interaction between histidine kinase sensor and non-cognate response regulator was found, indicating that individual two-component signal transduction systems are highly specific, well insulated and rare cross-talk [3].The high specificity of interaction between sensor and its cognate response regulator is accordant with the requirement for maintaining the faithful flow of signal through two-component system.Agrobacterium uses chemotaxis system to sense a large number of chemicals released by wounded host and VirA/VirG two-component system to induce the virulence gene expression [4,5].Chemotaxis signal transduction system is a special case of two-component system.Its histidine kinase CheA lacks transmembrane sensor domain and has three cognate response regulators, CheY1, CheY2 and CheB.Although the atypical two-component system, chemotaxis system is very different from the typical VirA/VirG two-component system, both of them are showed to be involved in Agrobacterium tumorigenesis [6].Our previous study suggested that chemotaxis signaling and virulence induction signaling may have crosstalk in Agrobacterium [3].Here, three lines of experimental evidences demonstrate the signaling cross-talk between these two two-component systems.1) Chemotaxis signal-driving run pattern of Agrobacterium cheA-deletion mutant could be adjusted by the complementation of VirA.2) Bacterial two hybrid assay showed that VirA interacts with CheY2 and CheA interacts with VirG.3) In vitro pull-down experiment showed that VirA can pull-down CheY2.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».