MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2965176684 · doi:10.1101/720466

A putative ER-PM contact site complex relocalizes in response to Rare Earth Elements –induced endocytosis

2019· preprint· en· W2965176684 sur OpenAlexafffund
EunKyoung Lee, Brenda Vila Nova Santana, Elizabeth Samuels, Francisco Benítez‐Fuente, Erica Corsi, Miguel A. Botella, Jessica Pérez‐Sancho, Steffen Vanneste, Jiřı́ Friml, Alberto P. Macho, Aristéa Alves Azevedo, Abel Rosado

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Stress Responses and Tolerance
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorCanada Research Chairs
Mots-clésEndocytosisCell biologyCytosolCalcium signalingCalmodulinBiophysicsChemistryCalciumBiologySignal transductionCellBiochemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT In plant cells, environmental stressors induce changes in the cytosolic concentration of calcium ([Ca 2+ ] cyt ) that are transduced by Ca 2+ -sensing proteins. To confer specificity to the stress signaling response, [Ca 2+ ] cyt sensing must be tightly regulated in space and time; the molecular mechanisms that restrict the localization and dynamics of Ca 2+ sensors in plants, however, are largely unknown. In this report, we identify a putative Ca 2+ -sensitive complex containing the synaptotagmins 1 and 5 (SYT1 and SYT5) and the Ca 2+ -dependent lipid binding protein (CLB1), which is enriched at ER-PM contact sites (EPCS) and relocalizes in response to Rare Earth Elements (REEs)-induced endocytosis. Our results show that endocytosed REEs influence cytosolic Ca 2+ signaling, as indicated by the activation of the Ca 2+ /Calmodulin-based ratiometric sensor GCaMP3, and promote the cytoskeleton-dependent accumulation of ER-PM contact sites at the cell cortex. Based on these results, we propose that the EPCS-localized SYT1/SYT5/CLB1 complex is part of an evolutionarily conserved and spatially regulated Ca 2+ -responsive mechanism that control cER-PM communication during stress episodes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)Même sujetPlant Stress Responses and ToleranceTravaux en français237 207