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Enregistrement W2965181622 · doi:10.1186/s40738-019-0059-7

15 years of transcriptomic analysis on endometrial receptivity: what have we learnt?

2019· review· en· W2965181622 sur OpenAlexaff
Soumaya Messaoudi, Amélie Bourdiec, Kimberley Crespo, Laurence Bissonnette, Cécile Le Saint, François Bissonnette, Isaac-Jacques Kadoch

Notice bibliographique

RevueFertility Research and Practice · 2019
Typereview
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueReproductive System and Pregnancy
Établissements canadiensUniversité de MontréalMontreal General HospitalComputer Research Institute of Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTranscriptomeReceptivityBiologyAndrologyComputer scienceMedicineEndocrinologyGeneticsGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Over the course of the last four decades, IVF has allowed an increasing number of infertile couples the chance to conceive. Considering the extensive research and advances in ART, too many IVF attempts still do not result in a successful pregnancy [ 1 , 2 ]. Embryo implantation is a crucial event in the establishment of a pregnancy. It is now clear that embryo implantation relies upon cross-talk and synchronicity between the implanting embryo and a receptive endometrium [ 3 ]. This embryo-maternal cross-talk involves an elaborate and coordinated network of communication via timely released embryonic, maternal-derived signals, and well-targeted actions [ 4 ]. If the clinical and culture conditions to obtain a “good quality” embryo are well advanced today, ER remains the last barrier in ART. When a high-quality embryo is transferred, impaired uterine receptivity is believed to be one of the major reasons behind failure of the establishment of pregnancy [ 5 , 6 ].

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,028

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,002
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0050,005
Science ouverte0,0010,003
Intégrité de la recherche0,0020,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,278
Tête enseignante GPT0,461
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations73
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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