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Enregistrement W2965195036 · doi:10.1200/cci.19.00022

Validation of a Cyclic Algorithm to Proxy Number of Lines of Systemic Cancer Therapy Using Administrative Data

2019· article· en· W2965195036 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJCO Clinical Cancer Informatics · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlobal Cancer Incidence and Screening
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineFollicular lymphomaNonparametric statisticsCohortAlgorithmChronic lymphocytic leukemiaCancerLymphomaInternal medicineProxy (statistics)OncologyLeukemiaStatisticsMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE Researchers are automating the process for identifying the number of lines of systemic cancer therapy received by patients. To date, algorithm development has involved manual modifications to predefined classification rules. In this study, we propose a supervised learning algorithm for determining the best-performing proxy for number of lines of therapy and validate this approach in four patient groups. MATERIALS AND METHODS We retrospectively analyzed BC Cancer pharmacy records from patients’ cancer diagnosis until end of follow-up (cohort-specific, 2014/2015). We created and validated a cyclic algorithm in patients with advanced cancers of varying histologies, diffuse large B-cell lymphoma, follicular lymphoma, and chronic lymphocytic leukemia. To assess internal and external validity, we used a split-sample approach for all analyses and considered lines of therapy identified through manual review as our criterion standard. We measured agreement using correlation coefficients, mean squared error, nonparametric hypothesis testing, and quantile-quantile plots. RESULTS Cohorts comprised 91 patients with advanced cancers, 121 with chronic lymphocytic leukemia, 440 with follicular lymphoma, and 679 with diffuse large B-cell lymphoma. Number of lines of therapy received and patients’ treatment period length varied substantially across cohorts. Despite these differences, our algorithm successfully identified a best-performing proxy for number of lines of therapy for each cohort, which was moderate to highly correlated with (within-sample: 0.73 ≤ Pearson correlation ≤ 0.84; out-of-sample: 0.52 ≤ Pearson correlation ≤ 0.76) and whose distribution did not significantly differ from the criterion standard within or out of sample ( P > .10). CONCLUSION Supervised learning is an ideal tool for generating a best-performing proxy that recognizes prescription drug patterns and approximates number of lines of therapy. Our cyclic approach can be used in jurisdictions with access to administrative pharmacy data.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,723
Score d'incertitude au seuil0,541

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,389
Tête enseignante GPT0,545
Écart entre enseignants0,156 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle