MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2965284760

Genome-wide association study of breakfast skipping

2019· article· en· W2965284760 sur OpenAlexaff
Martin K. Rutter

Notice bibliographique

RevueResearch Explorer (The University of Manchester) · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDiet, Metabolism, and Disease
Établissements canadiensLMC Diabetes & Endocrinology (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAssociation (psychology)Genome-wide association studyBiologyComputational biologyGeneticsMedicineGenotypeSingle-nucleotide polymorphismPsychologyGene
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Breakfast timing is the most heritable across meals, and little is currently known about the contribution of genetic variation to food timing. As breakfast timing is not routinely assessed in epidemiological studies, alternative approaches may include analyses of phenotypically related dietary traits.<br/>Objective: We aimed to elucidate breakfast timing genetic variants through a genome-wide association study (GWAS) for breakfast cereals skipping, a more commonly assessed trait.<br/>Design: We leveraged the statistical power of the UK Biobank (n=193,860) to identify genetic variants related to breakfast cereals skipping as a proxy for breakfast skipping and applied an array of in silico approaches to investigate mechanistic functions and links to traits/diseases. Next, we attempted replication in other breakfast skipping GWAS in the TwinUK (n=2,006) and the Cohorts for Heart and Aging Research in Genomic Epidemiology (CHARGE) consortium (n=11,963).<br/>Results: We identified six independent GWAS variants associated with breakfast skipping, including those implicated for caffeine (ARID3B), carbohydrate metabolism (FGF21), schizophrenia (ZNF804A), and those encoding enzymes important for N6-methyladenosine RNA transmethylation (METTL4, YWHAB, and YTHDF3), which regulates the pace of the circadian clock. Expression of identified genes was enriched in the cerebellum. Genome-wide correlation analyses indicated positive correlations with anthropometric traits. Through Mendelian randomization (MR), we observed causal links between genetically determined breakfast skipping and higher BMI, more depressive symptoms, and smoking. In bidirectional MR, we demonstrate a causal link between being an evening person and skipping breakfast, but not vice versa. We observed independent replication of our signals in a previous breakfast skipping GWAS in another British cohort (P=0.032), TwinUK, but not in a meta-analysis of non-British cohorts from the CHARGE consortium (P=0.095).<br/>Conclusions: Overall, our comprehensive GWAS approach identified six genetic variants for breakfast/food timing and supports the potential beneficial role of regular breakfast intake as part of a healthy lifestyle.<br/>

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,060
Score d'incertitude au seuil0,378

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueResearch Explorer (The University of Manchester)Même sujetDiet, Metabolism, and DiseaseTravaux en français237 207