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Enregistrement W2965485927 · doi:10.48550/arxiv.1908.00690

Feature Robustness in Non-stationary Health Records: Caveats to Deployable Model Performance in Common Clinical Machine Learning Tasks

2019· preprint· en· W2965485927 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevuearXiv (Cornell University) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueMachine Learning in Healthcare
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRobustness (evolution)Computer scienceHealth recordsArtificial intelligenceMachine learningFeature (linguistics)Health care

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

When training clinical prediction models from electronic health records (EHRs), a key concern should be a model's ability to sustain performance over time when deployed, even as care practices, database systems, and population demographics evolve. Due to de-identification requirements, however, current experimental practices for public EHR benchmarks (such as the MIMIC-III critical care dataset) are time agnostic, assigning care records to train or test sets without regard for the actual dates of care. As a result, current benchmarks cannot assess how well models trained on one year generalise to another. In this work, we obtain a Limited Data Use Agreement to access year of care for each record in MIMIC and show that all tested state-of-the-art models decay in prediction quality when trained on historical data and tested on future data, particularly in response to a system-wide record-keeping change in 2008 (0.29 drop in AUROC for mortality prediction, 0.10 drop in AUROC for length-of-stay prediction with a random forest classifier). We further develop a simple yet effective mitigation strategy: by aggregating raw features into expert-defined clinical concepts, we see only a 0.06 drop in AUROC for mortality prediction and a 0.03 drop in AUROC for length-of-stay prediction. We demonstrate that this aggregation strategy outperforms other automatic feature preprocessing techniques aimed at increasing robustness to data drift. We release our aggregated representations and code to encourage more deployable clinical prediction models.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,284
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0010,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,089
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle