Chemosynthetic bacterial signatures in Frenulata tubeworm Oligobrachia sp. in an active mud volcano of the Canadian Beaufort Sea
Notice bibliographique
Résumé
MEPS Marine Ecology Progress Series Contact the journal Facebook Twitter RSS Mailing List Subscribe to our mailing list via Mailchimp HomeLatest VolumeAbout the JournalEditorsTheme Sections MEPS 628:95-104 (2019) - DOI: https://doi.org/10.3354/meps13084 Chemosynthetic bacterial signatures in Frenulata tubeworm Oligobrachia sp. in an active mud volcano of the Canadian Beaufort Sea Dong-Hun Lee1, Jung-Hyun Kim2,*, Yung Mi Lee2, Young Keun Jin2, Charles Paull3, Dahae Kim2, Kyung-Hoon Shin1 1Hanyang University, 55 Hanyangdaehak-ro, Sangrok-gu, Ansan 15588, Republic of Korea 2Korea Polar Research Institute, 26 Songdomirae-ro, Yeonsu-gu, Incheon 21990, Republic of Korea 3Monterey Bay Aquarium Research Institute, 7700 Sandholdt Road, Moss Landing, California 95039, USA *Corresponding author: jhkim123@kopri.re.kr ABSTRACT: We performed bulk and compound-specific stable carbon isotope analyses to constrain specific carbon sources utilized for the chemosynthetic metabolisms of bacterial communities inhabiting the tube and worm of Oligobrachia sp. Together with bulk carbon isotopic compositions (-57.1 ± 1.2‰, mean ± SD) observed in the worm, the most depleted 13C values of predominant fatty acids (FAs) (i.e. C16:1ω7 [-71.4 ± 2.9‰] and C18:1ω7 [-76.7 ± 4.3‰]) indicated that sulfur-oxidizing symbionts were preferentially utilizing anaerobic oxidation of methane-derived dissolved inorganic carbon (-31.6 ± 4.2‰), rather than methane (-59.5 ± 3.9‰), as a carbon source. In contrast, the isotopic signatures of FAs of the tube sections indicated that both autotrophic and heterotrophic bacterial communities utilized dissolved inorganic carbon supplied from ambient bottom seawater and sediment porewater. In this regard, the metabolisms of chemosynthetic bacterial communities inhabiting the tube may be regarded as potentially supporting tubeworm nutrition. Given that the tubeworm host incorporates locally adapted microbial communities, the isotopic signatures suggest that different micro-niches identified from the tube and the worm, particularly in relation to complex metabolic interactions, may be correlated with in situ microbial processes in sediment and bottom seawater. KEY WORDS: Mud volcano · Siboglinid tubeworm · Sherlock microbial identification system · MIDI · Fatty acids · Carbon isotopic composition · δ13C Full text in pdf format Supplementary material PreviousNextCite this article as: Lee DH, Kim JH, Lee YM, Jin YK, Paull C, Kim D, Shin KH (2019) Chemosynthetic bacterial signatures in Frenulata tubeworm Oligobrachia sp. in an active mud volcano of the Canadian Beaufort Sea. Mar Ecol Prog Ser 628:95-104. https://doi.org/10.3354/meps13084 Export citation RSS - Facebook - Tweet - linkedIn Cited by Published in MEPS Vol. 628. Online publication date: October 10, 2019 Print ISSN: 0171-8630; Online ISSN: 1616-1599 Copyright © 2019 Inter-Research.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,007 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».