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Enregistrement W2965756418 · doi:10.1101/717868

Imprinted maternally-expressed microRNAs antagonize paternally-driven gene programs in neurons

2019· preprint· en· W2965756418 sur OpenAlexfundno aff
Amanda J. Whipple, Hannah N. Jacobs, Vincent Breton‐Provencher, Mriganka Sur, Phillip A. Sharp

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Syndromes and Imprinting
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteFonds de Recherche du Québec - SantéNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Institutes of HealthKoch Institute for Integrative Cancer Research, Massachusetts Institute of Technology
Mots-clésGenomic imprintingBiologymicroRNAGeneGene clusterGeneticsPsychological repressionRegulation of gene expressionGene expressionDNA methylation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary Imprinted genes with parental-biased expression are hypothesized to result from an evolutionary conflict between the parental genomes over procurement of maternal resources. Accordingly, imprinted genes are enriched in pathways regulating nutrient acquisition, energy homeostasis, and growth. Here, we functionally characterize a large cluster of maternally-expressed microRNAs (miRNAs) to explore why they evolved imprinted expression in neurons. Using an induced neuron (iN) culture system, we show maternally-expressed miRNAs from the miR-379/410 cluster repress paternally-expressed genes, including known regulators of energy homeostasis Plagl1 and Peg3 . Additional non-imprinted metabolic regulators are also co-targeted by miR-379/410. Maternal deletion of this imprinted miRNA cluster results in de-repression of its targets and up-regulation of a broader gene program regulating feeding behavior and synaptic transmission. These data suggest non-coding RNAs actively engage in parental genomic conflict, whereby maternally-expressed miRNAs antagonize paternally-driven gene programs in neurons.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,157
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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