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Enregistrement W2965938265 · doi:10.3390/genes10080594

Developmental Regulation of the Expression of Amaryllidaceae Alkaloid Biosynthetic Genes in Narcissus papyraceus

2019· article· en· W2965938265 sur OpenAlex
Tarun Hotchandani, Justine de Villers, Isabel Desgagné‐Penix

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueGenes · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueChemical synthesis and alkaloids
Établissements canadiensUniversité du Québec à Trois-Rivières
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversité du Québec à Trois-Rivières
Mots-clésAmaryllidaceaeLycorineAmaryllidaceae AlkaloidsAlkaloidNarcissusBiologyBulbGeneGene expressionTranscriptomeEnzymeComplementary DNAcDNA libraryBotanyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Amaryllidaceae alkaloids (AAs) have multiple biological effects, which are of interest to the pharmaceutical industry. To unleash the potential of Amaryllidaceae plants as pharmaceutical crops and as sources of AAs, a thorough understanding of the AA biosynthetic pathway is needed. However, only few enzymes in the pathway are known. Here, we report the transcriptome of AA-producing paperwhites (Narcissus papyraceus Ker Gawl). We present a list of 21 genes putatively encoding enzymes involved in AA biosynthesis. Next, a cDNA library was created from 24 different samples of different parts at various developmental stages of N. papyraceus. The expression of AA biosynthetic genes was analyzed in each sample using RT-qPCR. In addition, the alkaloid content of each sample was analyzed by HPLC. Leaves and flowers were found to have the highest abundance of heterocyclic compounds, whereas the bulb, the lowest. Lycorine was also the predominant AA. The gene expression results were compared with the heterocyclic compound profiles for each sample. In some samples, a positive correlation was observed between the gene expression levels and the amount of compounds accumulated. However, due to a probable transport of enzymes and alkaloids in the plant, a negative correlation was also observed, particularly at stage 2.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,055
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,201
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle