Molecular and morphological data reveal three new tribes within the Scirpo‐Caricoid Clade (Cyperoideae, Cyperaceae)
Notice bibliographique
Résumé
The circumscription of the circumboreal tribe Scirpeae has been contentious since the earliest infrafamilial classifications of the Cyperaceae (>100 genera, ~ 5500 species). Molecular phylogenetic studies place Scirpeae in a strongly supported clade with the enigmatic genusKhaosokiaand tribes Cariceae, Dulichieae, and Sumatroscirpeae, a lineage comprising more than 40% of all Cyperaceae species. This lineage was previously known as the Cariceae‐Dulichieae‐Scirpeae (CDS) clade. Here we informally characterize it as the “Scirpo‐Caricoid Clade”. Previous phylogenetic and phylogenomic studies of the Scirpo‐Caricoid Clade have shown Scirpeae to be paraphyletic, forming four distinct lineages that are successive sisters to a Cariceae + Sumatroscirpeae clade, thus confirming decade‐old suspicions that the modern circumscription of Scirpeae is unnatural. Using a total‐evidence phylogenetic analysis incorporating three plastid markers (matK,ndhF,rps16), two nuclear ribosomal markers (ETS‐1f, ITS), and 64 morphological characters, this study confirms the paraphyly of Scirpeae, the isolated phylogenetic position ofKhaosokia, and identifies morphological synapomorphies for seven monophyletic lineages that are here recognized as tribes. Our new classification places for the first time all genera of the Scirpo‐Caricoid Clade into natural tribes that are identifiable using morphological and embryological characters. Three new tribes are proposed: Calliscirpeae tr. nov., Khaosokieae tr. nov. and Trichophoreae tr. nov. Diagnoses for all tribes of the Scirpo‐Caricoid Clade, an identification key to all currently recognized Cyperaceae tribes, and identification keys for all genera of the Scirpo‐Caricoid Clade are provided.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».