MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2966014345 · doi:10.71781/3463

Études comparatives de la nociception chez Caenorhabditis elegans souche sauvage (N2) et mutants (egl-3 et egl-21)

2018· dissertation· fr· W2966014345 sur OpenAlexfundno aff
Bruno Nkambeu

Notice bibliographique

RevuePapyrus : Institutional Repository (Université de Montréal) · 2018
Typedissertation
Languefr
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaFondation de France
Mots-clésCaenorhabditis elegansNociceptionBiologyMutantGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

L’objectif de cette étude était de vérifier l’hypothèse selon laquelle, les mutants C. elegans (egl-3, egl-21, flp-18 et flp-21) auraient une diminution significative dans la production de neuropeptides matures bioactifs et présenteraient donc une diminution significative de la sensibilité aux stimuli nociceptifs. La nociception est une fonction défensive, une sorte d'alarme qui permet l’intégration de stimuli potentiellement dangereux pour l’organisme. L’intégration du stimulus au niveau du système nerveux se fait via l’activation de nocicepteurs. Caenorhabditis elegans (C. elegans) est un petit nématode majoritairement hermaphrodite, transparent, non parasite et non segmenté qui se nourrit de bactéries du genre Escherichia coli (E. coli). Il a un cycle de développement d’environ 3 jours à 22°C et une durée de vie d’environ 3 semaines. C. elegans est un organisme modèle largement utilisé pour examiner la réponse nocifensive aux stimuli nocifs. Une analyse complète de la séquence du génome révèle plusieurs gènes codant pour des pro-neuropeptides menant à une série de neuropeptides bioactifs. Les neuropeptides de C. elegans sont impliqués dans la modulation de tous les comportements, y compris la locomotion, la mécanosensation, la thermosensation et la chimiosensation. Nous avons soumis nos nématodes à des stimuli thermiques (30°C - 35°C) afin d’observer le comportement des souches sauvages et mutantes. Les résultats de nos études ont révélé une altération du comportement d'évitement thermique chez les mutants. Ce comportement d'évitement thermique des C. elegans mutants egl-3 et egl-21 était significativement entravé par rapport à la souche sauvage (N2). De plus, les C. elegans mutants flp-18 et flp-21 présentaient un phénotype similaire à egl-3 et egl-21. EGL-3 pro-protéine convertase et EGL-21 carboxypeptidase E sont des enzymes essentielles pour la maturation des pro-neuropeptides en neuropeptides actifs chez C. elegans. Les analyses d’abondance relative avec des homogénats de C. elegans mutants egl-3 et egl-21 ont démontré que la protéolyse de ProFLP-18 et ProFLP-21 était gravement entravée, conduisant à un manque de neuropeptides bioactifs matures. Pour déclencher une réponse nocifensive de C. elegans au stimuli thermique, les voies de signalisation des neuropeptides FLP-18 ou FLP-21 / NPR-1 sont nécessaires.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePapyrus : Institutional Repository (Université de Montréal)→Même sujetGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms→Travaux en français237 207→