Most <i>Plasmodiophora brassicae</i> Populations in Single Canola Root Galls from Alberta Fields are Mixtures of Multiple Strains
Notice bibliographique
Résumé
Clubroot, caused by Plasmodiophora brassicae, is an important disease on canola in Alberta, Canada. The pathogen is grouped into pathotypes according to their virulence reaction on differential hosts. Multiple pathotypes or strains are known exist in one field, one plant, or even one gall. This study was conducted with the objective of testing the prevalence of the coexistence of multiple strains in a single gall. In all, 79 canola clubroot galls were collected from 22 fields across Northern Alberta in 2018. Genomic DNA extracted from these single galls was analyzed using RNase H-dependent PCR (rhPCR). The rhPCR primers were designed to amplify a partial sequence of a dimorphic gene, with one primer pair specific to one sequence and the other primer pair specific to the alternative sequence. The amplification of both sequences from DNA obtained from a single gall would indicate that it contains two different P. brassicae strains. The rhPCR analyses indicated that the P. brassicae populations in 50 of the 79 galls consisted of more than one strain. This result emphasizes the need for cautious interpretation of results when a single-gall population is subject to pathotyping or being used as inoculum in plant pathology research. It also confirms that the maintenance of pathotype diversity within single root galls is a common occurrence which has implications for the durability, and stewardship, of single-gene host resistance.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».