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Enregistrement W2966265919

Unravelling the physiopathological role of sacsin, the protein mutated in the autosomal recessive spastic ataxia of Charlevoix-Saguenay (ARSACS).

2019· dissertation· en· W2966265919 sur OpenAlexaboutno aff
Fabiana Longo

Notice bibliographique

RevueIrInSubria (University of Insubria) · 2019
Typedissertation
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueGenetic Neurodegenerative Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAtaxiaGeneticsNeuroscienceBiologyMedicine
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sacsin is a large, multimodular protein encoded by the SACS gene and found only in vertebrates. It is expressed in the central nervous system, especially in Purkinje cells and corticospinal neurons. Bioinformatics’ predictions suggest that sacsin plays a role in protein quality control. However, to date sacsin physiological functions and subcellular localization are still open questions.\nLoss of function mutations in SACS gene cause Autosomal Recessive Spastic Ataxia of Charlevoix-Saguenay (ARSACS), an early-onset neurodegenerative disorder. Being sacsin function still unknown, the molecular pathogenesis leading to ARSACS has very poorly been investigated. My thesis is focused on exploring sacsin physiopathological role at the cellular level and on dissecting the pathogenesis of ARSACS.\nFirst, we examined how sacsin mutations alter the residual amount of the protein in ARSACS patient cells, since until now it has never been evaluated, leaving a hole in the genotypephenotype correlation in ARSACS.\nAt the same time, we investigated the effects of the lack of sacsin in different models depleted of its expression (ARSACS patient fibroblasts, SACS KO HeLa cells, Sacs KO mouse embryonic fibroblasts, and primary Purkinje neurons from the Sacs KO mouse model). We found alterations in mitochondrial dynamics, namely mitochondrial hyperfusion and, by dissecting the molecular mechanism, we demonstrated that the mitochondrial fission process was indeed impaired. In line with these results, we showed that mitochondrial hyperfusion has a strong impact on mitochondrial trafficking in primary Purkinje cells that lack sacsin expression. This highlights the importance of this phenotype in the pathogenesis of ARSACS, as Purkinje neurons are the first cells to be affected.\nIn sacsin-depleted cells, we detected a dramatic remodelling of the cytoskeletal network, particularly of intermediate filaments. Our data supports the hypothesis that sacsin may be involved in intermediate filament remodelling in an indirect manner, such as by regulating their folding. This is also suggested by the predicted chaperone-like activities of certain sacsin domains. An intermediate filament reorganization and/or accumulation could sterically hinder both transport and distribution of mitochondria in Purkinje neurons of Sacs KO mouse. On the other hand, cytoskeletal derangement could be responsible for impairing DRP1 recruitment.\nThe cellular phenotypes that we have identified in the absence of sacsin are steps forward in understanding the pathogenetic cascade of ARSACS and shed light on potential sacsin functions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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