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Enregistrement W2966347737 · doi:10.1101/723841

Investigating the biomechanical properties of streptococcal polysaccharide capsules using atomic force microscopy

2019· preprint· en· W2966347737 sur OpenAlexaff
Helina Marshall, Sebastián Aguayo, Mogens Kilian, Fernanda C. Petersen, Laurent Bozec, Jeremy Brown

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueStreptococcal Infections and Treatments
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilUniversity College London Hospitals NHS Foundation TrustNational Institute for Health and Care Research
Mots-clésStreptococcus mitisMicrobiologyStreptococcus pneumoniaeVirulenceSerotypeBacterial capsuleBacteriaBacterial cell structureBiologyAtomic force microscopyCapsuleStrain (injury)PolysaccharideChemistryStreptococcusMaterials scienceGeneticsNanotechnologyAnatomyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract In common with many bacterial pathogens, Streptococcus pneumoniae has a polysaccharide capsule, which facilitates immune evasion and is a key virulence determinant. However, recent data has shown that the closely related Streptococcus mitis can also express polysaccharide capsules including those with an identical chemical structure to S. pneumoniae capsular serotypes. We have used atomic force microscopy (AFM) techniques to investigate the biophysical properties of S. mitis and S. pneumoniae strains expressing the same capsular serotypes that might relate to their differences in virulence potential. When comparing S. mitis and S. pneumoniae strains with identical capsule serotypes S. mitis strains were more susceptible to neutrophil killing and imaging using electron microscopy and AFM demonstrated significant morphological differences. Force-volume mapping using AFM showed distinct force-curve profiles for the centre and edge areas of encapsulated S. pneumoniae and S. mitis strains. This “edge effect” was not observed in the unencapsulated streptococcal strains and in an unencapsulated Staphylococcus aureus strain, and therefore was a direct representation of the mechanical properties of the bacterial capsule. When two strains of S. mitis and S. pneumoniae expressed an identical capsular serotype, they presented also similar biomechanical characteristics. This would infer a potential relationship between capsule biochemistry and nanomechanics, independent of the bacterial strains. Overall, AFM was an effective tool to explore the biophysical properties of bacterial capsules of living bacteria by reproducibly quantifying the elastic and adhesive properties of bacterial cell surfaces. Using AFM to investigate capsule differences over a wider range of strains and capsular serotypes of streptococci and correlate the data with phenotypic differences will elucidate how the biophysical properties of the capsule can influence its biological role during infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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