Re-aerosolization in liquid-based air samplers induces bias in bacterial diversity
Notice bibliographique
Résumé
Bioaerosols collected in a liquid-based sampler can be re-aerosolized into the airflow during collection and lost or concentrated in the collection fluid and overestimated during the subsequent analyses. Very little information is available concerning the specific impact on bioaerosol quantification and diversity and wrong evaluation of pathogens or potentially harmful microorganisms concentration could lead to incorrect data interpretation and inaccurate exposure risk assessment. The aim of this two-part study was to better understand how evaporation impacts the results obtained from liquid-based samplers. Bacterial consortium was spiked in the collection vessels of the Coriolisµ® and the BioSampler® and the bacterial concentration was monitored after running the samplers in vitro. Relative ratios of the bacteria were analyzed using qPCR (before/after). A field study in which liquid-based air samplers in a natural environment were compared to filter-based samplers was performed. This allowed for the relative characterization of either concentration or the re-aerosolization between the two samplers using high throughput sequencing methods. Amongst the four strains of bacteria examined in vitro, results suggest differential behavior between concentration or re-aerosolization from the liquid. Re-aerosolization of bacteria is difficult to predict as the cell-surface hydrophobicity, the liquid-based air sampler and its flowrate can influence it. The sequencing results from field samples confirmed the loss of entire genera by re-aerosolization (Brevundimonas, Clostridium, Mycobacterium, and Smithella) out of the BioSampler® while concentration of several other genera were reduced (Bradyrhizobium, Delftia, Propionibacterium, and Sphingomonas). These observations suggest that evaporation in liquid samplers might lead to over- or underestimation of the prevalence of some genera.Copyright © 2019 American Association for Aerosol Research
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».