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Enregistrement W2966664004 · doi:10.1094/phyto-01-19-0015-r

Genetic Structure of <i>Rhizoctonia solani</i> AG-2-2IIIB from Soybean in Illinois, Ohio, and Ontario

2019· article· en· W2966664004 sur OpenAlexafffundabout
Olutoyosi O. Ajayi-Oyetunde, Sydney E. Everhart, Patrick J. Brown, Albert Tenuta, Anne E. Dorrance, Carl A. Bradley

Notice bibliographique

RevuePhytopathology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Disease Resistance and Genetics
Établissements canadiensMinistry of Agriculture, Food and Rural Affairs
Organismes subventionnairesNorth Central Soybean Research ProgramGrain Farmers of Ontario
Mots-clésBiologyRhizoctonia solaniPopulationAnalysis of molecular varianceGenetic diversityGenetic structurePopulation geneticsGene flowGenetic variationGeneticsEvolutionary biologyDemographyBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Rhizoctonia solani AG-2-2IIIB is an important seedling pathogen of soybean in North America and other soybean-growing regions around the world. There is no information regarding the population genetics of field populations of R. solani associated with soybean seedling disease. More specifically, information regarding genetic diversity, the mode of reproduction, and the evolutionary factors that shape different R. solani populations separated in time and space are lacking. We exploited genotyping by sequencing as a tool to assess the genetic structure of R. solani AG-2-2IIIB populations from Illinois, Ohio, and Ontario and investigate the reproductive mode of this subgroup. Our results revealed differences in genotypic diversity among three populations, with the Ontario population having greatest diversity. An overrepresentation of multilocus genotypes (MLGs) and a rejection of the null hypothesis of random mating in all three populations suggested clonality within each population. However, phylogenetic analysis revealed long terminal multifurcating branches for most members of the Ontario population, suggesting a mixed reproductive mode for this population. Analysis of molecular variance revealed low levels of population differentiation, and sharing of similar MLGs among populations highlights the role of genotype flow as an evolutionary force shaping population structure of this subgroup.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,495
Score d'incertitude au seuil0,856

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,178
Écart entre enseignants0,172 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2019
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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