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Enregistrement W2966729852 · doi:10.1097/rlu.0000000000002747

The Use of Random Forests to Classify Amyloid Brain PET

2019· article· en· W2966729852 sur OpenAlex
Katherine Zukotynski, Vincent Gaudet, Phillip H. Kuo, Sabrina Adamo, Maged Goubran, Christopher J.M. Scott, Christian Bocti, Michael Borrie, Howard Chertkow, Richard Frayne, Ging‐Yuek Robin Hsiung, Robert Laforce, Michael D. Noseworthy, Frank S. Prato, Demetrios J. Sahlas, Eric E. Smith, Vesna Sossi, Alexander Thiel, Jean-Paul Soucy, Jean‐Claude Tardif, Sandra E. Black

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueClinical Nuclear Medicine · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDementia and Cognitive Impairment Research
Établissements canadiensHealth Sciences CentreUniversité de MontréalUniversité LavalMontreal Heart InstituteUniversity of British ColumbiaMontreal Neurological Institute and HospitalUniversity of WaterlooFoothills Medical CentreUniversity of CalgarySunnybrook Health Science CentreJewish General HospitalUniversity of TorontoUniversité de SherbrookeWestern UniversityMcMaster UniversityHotchkiss Brain InstituteSunnybrook Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineRandom forestAmyloid (mycology)Artificial intelligencePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: To evaluate random forests (RFs) as a supervised machine learning algorithm to classify amyloid brain PET as positive or negative for amyloid deposition and identify key regions of interest for stratification. METHODS: The data set included 57 baseline F-florbetapir (Amyvid; Lilly, Indianapolis, IN) brain PET scans in participants with severe white matter disease, presenting with either transient ischemic attack/lacunar stroke or mild cognitive impairment from early Alzheimer disease, enrolled in a multicenter prospective observational trial. Scans were processed using the MINC toolkit to generate SUV ratios, normalized to cerebellar gray matter, and clinically read by 2 nuclear medicine physicians with interpretation based on consensus (35 negative, 22 positive). SUV ratio data and clinical reads were used for supervised training of an RF classifier programmed in MATLAB. RESULTS: A 10,000-tree RF, each tree using 15 randomly selected cases and 20 randomly selected features (SUV ratio per region of interest), with 37 cases for training and 20 cases for testing, had sensitivity = 86% (95% confidence interval [CI], 42%-100%), specificity = 92% (CI, 64%-100%), and classification accuracy = 90% (CI, 68%-99%). The most common features at the root node (key regions for stratification) were (1) left posterior cingulate (1039 trees), (2) left middle frontal gyrus (1038 trees), (3) left precuneus (857 trees), (4) right anterior cingulate gyrus (655 trees), and (5) right posterior cingulate (588 trees). CONCLUSIONS: Random forests can classify brain PET as positive or negative for amyloid deposition and suggest key clinically relevant, regional features for classification.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,059
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,086
Tête enseignante GPT0,412
Écart entre enseignants0,326 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle