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Enregistrement W2966770475 · doi:10.1101/726323

Correlates of hybridization in plants

2019· preprint· en· W2966770475 sur OpenAlexaff
Nora Mitchell, Lesley G. Campbell, Jeffrey R. Ahern, Kellen C. Paine, Aelton Biasi Giroldo, Kenneth D. Whitney

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant and animal studies
Établissements canadiensToronto Metropolitan University
Organismes subventionnairesDivision of Environmental BiologyNational Science Foundation
Mots-clésBiologyEvolutionary biologyOutcrossingPhylogenetic treePlant evolutionGeneticsGenomeEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Hybridization is a biological phenomenon increasingly recognized as an important evolutionary process in both plants and animals, as it is linked to speciation, radiation, extinction, range expansion and invasion, and allows for increased trait diversity in agricultural and horticultural systems. Estimates of hybridization frequency vary across taxonomic groups, and previous work has demonstrated that some plant groups hybridize more frequently than others. Here, we ask on a global scale whether hybridization is linked to any of 11 traits related to plant life history, reproduction, genetic predisposition, and environment or opportunity. Given that hybridization is not evenly distributed across the plant tree of life, we use phylogenetic generalized least squares regression models and phylogenetic path analysis to detect statistical associations between hybridization and plant traits at both the family and genus levels. We find that perenniality and woodiness are each associated with an increased frequency of hybridization in univariate analyses, but path analysis suggests that the direct linkage is between perenniality and increased hybridization (with woodiness having only an indirect relationship with hybridization via perenniality). Associations between higher rates of hybridization and higher outcrossing rates, abiotic pollination syndromes, vegetative reproductive modes, larger genomes, and less variable genome sizes are detectable in some cases but not others. We argue that correlational evidence at the global scale, such as that presented here, provides a robust framework for forming hypotheses to examine and test drivers of hybridization at a more mechanistic level. IMPACT SUMMARY Although historically thought of as rare, inter-specific mating is increasingly recognized as an important evolutionary process. Hybridization can generate increased genetic and morphological variation and has been tied to increased diversification and other biological phenomena such as geographic range expansion and the success of invasive species. Here, we examine hybridization of plants on a global scale. Previous work has demonstrated that some plant groups hybridize more than others, but the reasons for this pattern remain unclear. We combine data from eight regional floras with trait data to test for associations between hybridization and different aspects of plant biology, such as life history, growth form, reproduction, and opportunity, all while accounting for the fact that plant lineages are related to each other. We find that plant groups that are dominated by perennial species and species with woody growth forms tend to hybridize more than those dominated by annual or herbaceous species. We also find some evidence that frequent hybridization is found in plant families that are predominantly pollinated abiotically (such as by wind or water) or have higher rates of outcrossing, plant genera that have less variable genome sizes, and plant groups (both genera and families) that can reproduce asexually and have larger genome sizes. This study provides the first analysis of the global correlates of hybridization in plants. Although this correlational evidence does not provide any mechanistic explanations for these patterns, the trends we find are novel in terms of both geographic and taxonomic sale. The correlations detected provide robust hypotheses for understanding the conditions for hybridization and its contributions to evolution.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,192
Écart entre enseignants0,167 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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