IDDF2019-ABS-0299 Gut microbiome diversity and specific microbial genera correlate with the severity of non-alcoholic liver disease in indonesia
Notice bibliographique
Résumé
Background The prevalence of nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD) is increasing. In Indonesia Hasan, I et al. (2002) reported the prevalence of 30.6%. This study evaluated the first time the profile of gut microbiota and correlation with severity of NAFLD in Indonesia. Methods We included 37 subjects age 18–60 years. The characteristic data of the patients and the food recalls were recorded. Abdominal ultrasound, liver transient elastography with controlled attenuation parameter (CAP) were performed. Next generation 16S rRNA metagenomic sequencing was conducted using stool samples. The Spearman correlation test was used to examine the correlation between specific microbial taxa with the severity of NAFLD based on fibrosis and steatosis degree. Results The subjects included 62.2% (n=23) females and 37.8% males (n=14), mean age 50 ± 7.93 years old. They were divided based on fibrosis and steatosis degree into non-significant and significant fibrosis using cut off 7 KPa, mild and moderate-severe steatosis based on cut off 270 dB/m. From all subjects, we got 73% vs 27% non-significant and significant fibrosis, 51.4% vs 48.6% mild and moderate-severe steatosis. At the phylum level, the proportion of Bacteriodetes did not change in fibrosis or steatosis group. The proportion of Proteobacteria and Firmicutes was different in fibrosis and steatosis groups. Actinobacteria unknown bifidobacteriales bifidobacteriaceae bifidobacterium Bifidobacterium adolescentis correlate positively with non significant fibrosis (r = 0.532; p=0.004). Firmicutes clostridia clostridiales lachnospiraceae unknown fusicatenibacter saccharivorans and Firmicutes clostridia clostridales ruminococcaceae unknown [clostridium] leptum correlate negatively with significant fibrosis (r = -0.695; p=0.026 vs r = -0.732; p=0.016). In the group of steatosis, we got Bacteroidetes bacteroidia bacteroidales rikenellaceae alistipes alistipes onderdonkii and Firmicutes clostridia clostridales oscillospiracea oscillospiraceao scilibacter ruminantum correlate negatively with moderate-severe steatosis (r = -0.478; p=0.045 vs r = -0.518; p=0.028); Bacteroidetes bacteroidia bacteroidales rikenellaceae alistipes alistipes putredinis correlate positively with mild steatosis (r = 0.503; p=0.028). Conclusions The abundance of microbiota in NAFLD are not significantly different based on the group of fibrosis and steatosis, especially in phylum level. But at the lower level, some specific microbiota may correlate with the degree of fibrosis and steatosis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,063 | 0,014 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».